研究发现羊水细胞RNA测序对罕见疾病的诊断潜力

　　

   

   

图片:香港医学大学研究小组发现羊水细胞rna测序在诊断罕见疾病方面的潜力，为全球首个概念验证研究。研究小组成员包括:(左起):区良权博士、崔文春博士、麦俊玉博士、钟汉贤博士、阚锡攸博士、李美娟博士、邝家怡博士    

资料来源:香港大学

由香港大学乐科医学院临床医学院儿科及青少年医学系及妇产科学系组成的临床研究小组，率先发现将妊娠16至24周期间获得的羊水细胞作为一种新的样本类型，用于产前诊断的rna测序，以帮助更多家庭进行量身定制的临床管理。这是文献中首次证明羊水细胞rna测序的潜在临床应用的概念验证研究。这一突破性的发现已经发表在领先的学术期刊上。

背景  

罕见病通常是遗传性的。根据研究小组之前的研究，虽然个别罕见，但在香港人口中，集体罕见疾病的比例为1 / 67。^[1] 发现罕见病的遗传原因，可以为更好的临床管理和未来怀孕规划提供准确的咨询，对支持患者至关重要。目前的产前诊断技术主要基于dna，有很大一部分(60-70%)仍未确诊，导致临床不确定性和父母焦虑。最近，人们发现rna测序可以将诊断率提高10%到36%，^[2]然而，这些研究都没有关注产前诊断。此外，尽管有成熟的大型数据库，可以对成人不同组织的基因表达谱进行编录，但缺乏反映胚胎和胎儿阶段的羊水细胞的类似公开数据集。因此，有必要对产前rna测序进行进一步研究。

研究发现  

研究小组证明了羊水细胞rna测序的潜在临床应用价值。通过对50多个羊水样本进行rna测序，建立了羊水细胞基因表达谱的基线。建立基因表达谱是将rna测序应用于当前选定的临床诊断工作流程的关键步骤。他们发现，羊水细胞中表达良好的基因的数量与其他临床可达组织相当，通常用于不同疾病类别的遗传诊断。该研究小组还将四个患有结构性先天性异常的受影响胎儿的rna测序数据与既定基线进行了比较，以检测潜在的异常值。在与德国慕尼黑工业大学的合作中，生物信息学管道被用于增强异常值的检测，以进行后续分析。进一步深入的研究表明，在所有四个受影响的胎儿中，都可以在与相应的先天性结构性异常相关的基因中识别出异常值。识别异常值可以在RNA水平上提供更多的证据，以帮助诊断。

研究意义  

这项研究的结果对解决香港未确诊的罕见疾病有重要意义。这是文献中首次报道羊水细胞rna测序在产前诊断中提供潜在的临床应用。随着遗传原因的确定，有可能对有家族史的家庭进行量身定制的临床管理和胚胎植入前遗传学诊断等精准医疗。

这项研究被选为美国人类遗传学学会(ASHG) 2022年年会的“审稿人选择摘要”(海报摘要的前10%)，这是同类会议中规模最大的会议之一，来自世界各地的科学家被选中合作展示他们的前沿研究成果[链接到摘要]。“港大的海报在这个著名的国际会议中被选为海报摘要的前10%，我们深感荣幸。”rna测序在解决无法解释的遗传疾病方面具有巨大潜力。香港医学大学临床医学院儿科及青少年医学系临床副教授、临床遗传学家钟汉贤博士说:“我们会继续加强与本港及海外机构的联系和合作，为国际科学研究作出贡献，并让本港的病人受惠。”

港大临床医学院妇产科名誉临床副教授兼灿玉医院产前诊断实验室副主任简诗攸医生补充说:“在灿玉医院百周年庆之际，这项研究显示了灿玉医院在过去一个世纪为香港提供卓越服务，并不断努力为有需要的人作出贡献，并进行创新研究。”

文章标题

Diagnostic potential of the amniotic fluid cells transcriptome in deciphering mendelian disease: a proof-of-concept