多组学技术揭开视网膜母细胞瘤的潜在治疗靶点

　　

视网膜母细胞瘤（Rb）是一种致命的儿童眼癌，通常由RB1肿瘤抑制因子的失活引起。尽管在过去几十年患者的存活率有了明显改善，但严重的视力损害和失明仍然很常见，部分原因在于化疗的耐药性和毒性。

近日，迈阿密大学米勒医学院等机构的研究人员采用多组学方法来解析RB1肿瘤抑制因子失活对下游通路的影响。他们发现雌激素相关受体γ（ESRRG）是视网膜母细胞瘤中缺氧适应和细胞存活的重要介导因子。

这篇题为“RB1 loss triggers dependence on ESRRG in retinoblastoma”的文章于8月19日发表在《Science Advances》杂志上。作者认为，更好地了解视网膜母细胞瘤的分子依赖性也许会带来更有效的靶向疗法。

在这项研究中，研究人员对103个原发性视网膜母细胞瘤样本开展了外显子组测序，并对4个原发性肿瘤样本进行了全基因组测序。同时，他们还借助RNA测序实验和单细胞RNA测序实验分析了基因表达。

他们的结果表明，视网膜母细胞瘤中特征性的RB1失活使得雌激素相关受体γ（ESRRG）不受RB1的常规调控，这明显促进了ESRRG表达，特别是在肿瘤细胞存在的缺氧条件下。

“我们发现，ESRRG是视网膜母细胞瘤中缺氧适应和细胞存活的介导因子，它受到RB1缺失的组成型激活，随后受到反复出现的基因组畸变的影响，”作者在文中写道。“这些结果表明，Rb进展期间的选择性压力增加了ESRRG活性，并为治疗提供了潜在的靶点。”

除了大多数肿瘤样本（94%）中出现的RB1突变，研究团队还追踪到BCOR、NSD1、BRCA2、FCGBP和PI4KA等基因中的复发突变，以及1号、6号和16号等染色体的反复增加和缺失。

他们指出，值得注意的是，这些反复突变基因编码的大多数蛋白质都参与了雌激素受体/雌激素相关受体（ESR/ESRR）蛋白质互作网络，参与发育、神经发生、代谢、缺氧和细胞周期调控。

研究团队根据转录组分析和单细胞RNA-seq实验的结果，将后续分析的重点放在ESRRG上。同时，染色体分析的结果也表明，包含ESRRG基因的1号染色体区域出现了反复增加和缺失。

接着，他们通过染色质免疫沉淀（ChIP）测序、ChIP-qPCR、互作网络分析、免疫共沉淀实验和报告基因分析等方法，对ESRRG开展了深入分析，以便了解其在视网膜母细胞瘤中的调控和潜在作用。结果突出了ESRRG与RB1的相互作用，而RB1似乎抑制了ESRRG活性。

在缺乏RB1的情况下，研究人员发现ESRRG表达显著上升，并增强了缺氧反应。之后，他们使用shRNA对ESRRG进行敲低，或使用ESRRG激动剂GSK5182，发现细胞死亡和出现缺氧敏感性。

“总的来说，这些结果表明RB1抑制了缺氧诱导的ESRRG活性激增，而RB1的缺失破坏了这种稳态机制，导致新生的视网膜母细胞瘤细胞在缺氧的肿瘤微环境中越来越依赖ESRRG，”作者补充说。他们认为有必要进一步研究抑制ESRRG在肿瘤治疗中的潜在作用。

原文检索

RB1 loss triggers dependence on ESRRG in retinoblastoma

SCIENCE ADVANCES 19 Aug 2022 Vol 8, Issue 33
DOI: 10.1126/sciadv.abm8466