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一种不依赖于gRNA的新型RNA精准编辑系统
【字体: 大 中 小 】 时间:2022年08月31日 来源:中国科学院上海营养与健康研究所
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2022年8月27日,中国科学院上海营养与健康研究所的王泽峰团队在Nucleic Acids Research杂志发表长文Programmable RNA base editing with a single gRNA-free enzyme
2022年8月27日,中国科学院上海营养与健康研究所的王泽峰团队在Nucleic Acids Research杂志发表长文Programmable RNA base editing with a single gRNA-free enzyme。该研究报道了一种单一组分的新型可编程RNA单碱基编辑系统REWIRE(RNA editing with individual RNA-binding enzyme),可以在人体细胞中实现高达60%-80%的A-to-I或C-to-U编辑。该系统利用一种人源PUF蛋白来靶向识别RNA序列。PUF蛋白包含一个RNA结合域,称为Pumilio同源域或PUF域,这个RNA结合域通常由八套36个氨基酸的重复序列组成。每个重复序列上有三个氨基酸残基在和RNA的结合中起重要作用。通过对可编程PUF结构域的设计和对其长度的优化,该系统可以实现对8-10nt的目标序列精准定位高效编辑靶标的同时降低脱靶效应。
图:REWIRE系统及其优化策略