AlphaFold解析了迄今为止最复杂的蛋白质结

美因茨约翰内斯古登堡大学的理论物理学家对谷歌的人工智能AlphaFold进行了测试，发现了迄今为止最复杂的蛋白质结。

　　

   

   

AlphaFold预测的最复杂的七个交叉的蛋白质结(左)和一个简化的表示(右)    

蛋白质的化学成分，即氨基酸序列，如何决定其三维结构的问题，是半个多世纪以来生物物理学面临的最大挑战之一。这种关于所谓蛋白质“折叠”的知识需求量很大，因为它对理解各种疾病及其治疗等方面有重大贡献。出于这些原因，谷歌的DeepMind研究团队开发了AlphaFold，这是一款可以预测3D结构的人工智能。

一个由美因茨约翰内斯·古登堡大学(JGU)和加州大学洛杉矶分校的研究人员组成的团队现在已经仔细研究了这些结构，并研究了它们与绳结的关系。打结会在我们细胞的纳米尺度上发生。结蛋白不仅可以用来评估结构预测的质量，还可以提出关于折叠机制和蛋白质进化的重要问题。

最复杂的结作为AlphaFold的测试  

美因茨大学Peter Virnau博士小组的博士生Maarten a . Brems说:“我们对AlphaFold的所有新蛋白质结的预测进行了数值研究，大约有10万个。”他们的目标是找出含有复杂且未知的蛋白质结的稀有、高质量结构，为AlphaFold的预测提供实验验证的基础。这项研究不仅发现了迄今为止最复杂的结状蛋白质，而且还发现了蛋白质中的第一个复合结。后者可以被认为是同一根弦上的两个不同的结。参与该项目的理论物理学家罗伯特·朗克尔(Robert Runkel)补充说:“这些新发现还为这种罕见蛋白质背后的进化机制提供了见解。”

Peter Virnau博士对结果很满意:“我们已经和来自加州大学洛杉矶分校的同事Todd Yeates建立了合作关系，通过实验来确认这些结构。这条研究路线将塑造生物物理学界对人工智能的看法。”

AlphaFold predicts the most complex protein knot and composite protein knots