华南植物园在象腿蕉染色体级别基因组组装研究获新进展

　　

 

　　象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉类植物，原产于中国云南和东南亚地区，具有重要的观赏、饲用和药用价值。华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队，采用单分子纳米孔、Illumina测序策略，结合染色体构像捕获技术，发表了首个象腿蕉染色体级别的基因组序列，长度为481.5 Mbp，完整性较高(BUSCO 98.3%)，注释获得36,836个编码基因，重复序列约占基因组的55%。象腿蕉与芭蕉属(Musa)代表物种的比较基因组学研究发现，象腿蕉的长末端重复序列的组成及其插入时间，与芭蕉科其他物种均有差异，芭蕉属比象腿蕉属有更多Copia，象腿蕉LTR插入时间(峰值3.5–5 Mya)比芭蕉属物种(峰值2 Mya)更古老，还发现芭蕉科在9和11染色体基数进化过程中复杂多样的染色体重组事件。研究结果为蕉类作物保育和改良提供重要的基因组资源。 

　　相关研究成果以“A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity and chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae”为题，在基因组领域有影响力的国际杂志Gigascience (IF2020=6.5)上发表。王梓维为该文第一作者，John Seymour Heslop Harrison教授和刘青副研究员为通讯作者，华南植物园葛学军教授和法国农业科学中心Mathieu Rouard教授参与该项工作。本研究得到了华南植物园海外知名学者项目、国家自然科学基金、广东省基础与应用基础研究基金的资助。论文链接：https://doi.org/10.1093/gigascience/giac027