测序新星Element Biosciences推出首款短读长测序仪

Element Biosciences公司近日发布了他们的第一款测序仪——Element AVITI系统，这是一款台式测序仪，能够提供出色的性能、更低的成本和更高的灵活性。

据悉，Element专有的Avidity短读长测序试剂能够带来其他台式系统无法比拟的准确性和成本效益。AVITI系统可独立运行两个流动槽，为用户带来极大的灵活性。AVITI操作软件也具有可调节读取通量的功能，在运行时间方面带来了更多的灵活性。

AVITI系统的主要参数如下：

▪ 2x150 bp双端读长
▪ 2x150 bp读长下的Q30 > 90%
▪ 每个流动槽可产生800M+双端reads
▪ 每个流动槽可产生240 Gb数据
▪ 2个随机存取流动槽，总共可产生480 Gb数据
▪ 13-48个小时的运行时间
▪ 每Gb成本5-7美元（由流动槽产量决定）

首席技术官Michael Previte在发布会上谈到了Element是如何不断改进的，其重点在于最大化信噪比：让信号最大化，同时让背景最小化。他还强调了两个独立流动槽带来的灵活性，认为“它本质上是一台仪器内有两个测序系统，你可以启动一侧的流动槽，然后待会儿回来再启动另一个。”Previte还表示，该系统未检测出标签跳跃（index hopping）。

同时，Element还与NGS文库制备和生物信息学领域的多家公司合作，包括安捷伦、QIAGEN、NEB、罗氏、10x Genomics等。这些被称为创新合作伙伴的早期客户将获得2个免费的试剂盒和一年额外保修。

Element Biosciences公司的首席执行官兼联合创始人Molly He表示：“随着AVITI系统的推出，Element正在实现其愿景，即普及高质量、低成本且易用的基因组学工具。通过最近对Loop Genomics的收购，我们将在一个平台上同时提供短读长和长读长测序功能。AVITI将为用户带来前所未有的自由度和灵活性。”

今年2月，Element Biosciences宣布已完成对Loop Genomics的收购。通过将Element的高精度短读长测序平台与Loop的简单且可扩展的长读长解决方案相结合，客户将能够在同一平台上实现短读长和长读长应用。

Loop Genomics的创始人Tuval Ben-Yehezkel现已加入Element Biosciences。他解释了如何利用短读长测序仪来实现长读长测序，以解决定相问题。主要是在样本上添加独特分子标识符（UMI），以了解哪些变异与同一条核酸链相关联。在测序获得短读长后，通过软件重新组装，然后推断原始的长序列，也就是“合成长读长”。

刚刚加入Element并担任应用和科学事务高级副总裁的Shawn Levy表示：“在Beta测试中，文库兼容性和测序性能都和我们预期的一样好。采用AVITI系统的用户可对工作流程和数据质量充满信心。”Levy之前曾在Hudson Alpha研究所参与AVITI系统的测试工作。

Element目前已发布了七份应用指南和技术指南，以及五个可供下载的测序数据集，覆盖人类全基因组、细菌全基因组和RNA-seq分析。公司现已开始接受AVITI系统的订单，预计从2022年第二季度开始发货。

AVITI测序仪的定价为28.9万美元。不过，Molly He表示他们可能会提供批发价。“我们正在考虑基于数量的折扣。这将是透明的。”