利用血液DNA进行免疫分析的新方法

研究人员介绍了一种新的、详细的免疫分析方法，该方法可以在不需要新鲜样本或完整细胞的情况下测量DNA的修饰。该技术使用最少的样本输入，在不同条件下存储血液DNA，并为人群、临床和药理学研究中的标准化详细免疫分析提供了有希望的解决方案。

　　

Norris Cotton癌症中心(NCCC)的研究人员与布朗大学公共卫生学院、加州大学旧金山分校(UCSF)和堪萨斯大学医学中心(KUMC)合作，介绍了一种新的免疫分析方法，该方法仅使用来自血液而不是新鲜细胞样本的DNA就能报告特定的免疫细胞类型。他们的方法“利用DNA甲基化增强外周血细胞反褶积以获得高分辨率的免疫图谱”最近发表在《Nature Communications》杂志上。

“我们的技术需要最小的投入来使用不同条件下储存的血液DNA样本，”该研究的主要作者Lucas A. Salas博士说，他是NCCC癌症人口科学研究项目(CPS)的成员和达特茅斯盖泽尔医学院的流行病学助理教授。“这在人口流行病学研究中是理想的，可能也适用于无法立即处理样本的临床环境。”

“我们的论文详述了一种新方法，它提供了一种强大的替代传统的基于血液DNA而不是完整活细胞的流式细胞术，”UCSF人类遗传学研究所的合著者John Wiencke补充道。

这种新方法提供了一个机会，利用美国和世界各地的生物库中储存的数百万份血样，来询问和回答有关健康和疾病中的免疫系统的问题——这些血样已经因为其他原因存在了。在临床环境中，全血细胞计数(CBC)鉴别通常用于诊断病人的情况，并仅限于五种一般的免疫细胞类型。该方法将免疫细胞鉴定扩大到包括幼稚、记忆性T、B细胞等不能用CBC鉴定的12种免疫细胞。

大规模的人群研究和临床试验现在可以以一种标准化的、具有成本效益的方式获取个人免疫状况的详细信息，而不受现有方法的一些限制。这一进展为系统免疫因子在疾病和衰老中的新研究奠定了基础。Salas说:“与标准的临床方法相比，这种方法不仅可以获得两倍多的细胞类型，而且因为它不依赖于表面标记物或完整的细胞，它可以用于新鲜或存档的血液。”

当该方法应用于癌症患者时，观察了化疗和放疗的免疫谱反应。通讯作者、CPS联合主任Brock C. Christensen博士正在研究这种新方法如何帮助预测免疫治疗的反应。Christensen说:“用我们的新方法进行详细的免疫分析，有望发现对现有和正在出现的癌症免疫疗法以及其他免疫调节药物的反应的生物标志物。这项技术在推进癌症免疫预防方面也有很大潜力。”

该团队的下一步是评估这个新工具的许多潜在用途，以了解它如何最好和最直接地造福临床医生和患者。这种技术可能引发临床医生、患者和研究人员利用和理解健康和疾病中的免疫系统信息的范式转变。

Lucas A. Salas, Ze Zhang, Devin C. Koestler, Rondi A. Butler, Helen M. Hansen, Annette M. Molinaro, John K. Wiencke, Karl T. Kelsey, Brock C. Christensen. Enhanced cell deconvolution of peripheral blood using DNA methylation for high-resolution immune profiling. Nature Communications, 2022; 13 (1)