Takara新品|含UMI的单细胞RNA-Seq分析试剂盒来咯！

单细胞转录组测序是指在单个细胞水平上，对转录组等遗传信息进行高通量测序分析的一项技术。  研究罕见或珍贵的样本，比如神经元细胞、干细胞、CTC等，需要非常高的灵敏度和再现性，因为单个细胞中RNA的含量十分有限（根据单个细胞的大小等情况不同，每个细胞可能只含有几十皮克的RNA）。因此，生成没有偏倚的mRNA-seq cDNA文库是很具有挑战性的一项工作。

创新研究不断推动新技术的边界，以获得引人注目的结果，而这其中仍然需要试剂、技术的支撑。在单细胞RNA-seq领域，Takara Bio提供的SMART技术，可以帮助研究人员进一步突破RNA-seq灵敏度上限，提供高质量的单细胞转录组分析结果。本次推荐的新品SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)，就是整合UMI的单细胞/微量样本的mRNA全长分析建库试剂盒。

产品亮点

• “高端”的技术万里挑一

基于Takara Bio的核心SMART技术(Switching Mechanism at 5' End of RNA Template)优化改良，提供全长转录本信息，可以高灵敏度地在单细胞水平上分析差异表达、融合基因、可变剪接等。

• 加持的“标签”鼎力相助

通过逆转录步骤添加分子标签（UMIs），可以灵敏地识别PCR重复片段，并校正PCR扩增错误，从而获得更高准确性的基因或转录本检测数。

• 连贯的文库构建流程

同时整合了Takara Bio专利性 的文库构建技术（U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, 和11,072,823），利用特别的茎环形接头构建高品质Illumina文库！另外，搭配使用Unique Dual Index Kits（单独销售），可以提供完整的从样品到cDNA合成，再到文库构建的实验体验。同时搭配特别开发的Cogent NGS生物信息学分析软件，能直接对下机数据进行分析！

性能展示

• 再现性测试数据

以10 pg K562 RNA以及3种不同起始量 (100 pg, 1 ng和10 ng)的 UHR RNA样本起始，使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)构建测序文库，均做3个重复。然后进行测序，并使用CogentAP进行分析。结果显示，重复之间相关性系数非常高。即使起始量为10 pg时，也具有非常高的重现性！

• 灵敏度测试数据

对36例核酸含量较低的PBMC样本，使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)制备文库，并进行测序分析。结果显示，通过基因表达谱分析确认了70%的PBMC是T细胞，这符合来自正常健康供体的PBMC预期比例。此外，还鉴定确认一个B细胞、一个NK细胞，一个单核细胞和两个树突状细胞，另有6个细胞无法明确类型。由此也说明SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在单细胞水平的RNA-Seq分析上具有高灵敏度。
 
• 添加UMI校正偏差

分别对10 pg RNA和单个细胞获得的RNA样本，掺入ERCC control RNA后进行文库制备，然后进行测序分析。结果显示，添加UMI后，决定系数R2值明显提高，表明添加UMI降低PCR duplication，获得更准确的RNA counts。

• 兼容自动化平台

SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)兼容多种自动化液体工作站进行微缩化建库。比如使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在Mantis Liquid Handler (Formulatrix)上将反应体系体积微缩至1/2（HV），1/4（QV）以及在mosquito HV liquid handler (SPT Labs)上将反应体系体积微缩至1/8，均能获得与使用原反应体系高度一致的结果。保证性能的同时，降低了成本和操作时间！
 
PS：另外还有两款新品，也值得关注哦！

• SMART-Seq mRNA LP：少量细胞/微量样本的mRNA-Seq文库构建试剂盒。它使用oligo(dT)引物起始，优化用于从10 pg-100 ng的高品质total RNA(RIN≥8)或1-1000个完整细胞起始，生成高质量的测序文库。
• SMART-Seq mRNA：少量细胞/微量样本的cDNA合成试剂盒。它可以用于Ultra low RNA（10 pg-100 ng）或少量细胞（1-1000个完整细胞）cDNA合成的试剂盒，提供全长转录本的信息。

Code No.	产品名称	包装量
634762	SMART-Seq mRNA LP(with UMIs)	24 Rxns
634765	SMART-Seq mRNA LP(with UMIs)	96 Rxns
634766	SMART-Seq mRNA LP(with UMIs)	4×96 Rxns