深圳大学医学部吉坤美/陈家杰课题组成功绘制出染色体级别的粉尘螨基因组图谱

【字体: 时间:2021年10月01日 来源:深圳大学

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  深圳大学医学部吉坤美/陈家杰课题组联合北京协和医院变态反应科孙劲旅教授、深圳易码生物科技公司李江等采用NGS、PacBio和Nanopore三种测序技术,并提取了粉尘螨虫卵DNA,最大限度消除了螨虫体内消化道微生物基因组的污染,成功绘制出第一个粉尘螨基因组和转录精细图谱

  

近日,深圳大学医学部吉坤美/陈家杰课题组联合北京协和医院变态反应科孙劲旅教授、深圳易码生物科技公司李江等采用NGS、PacBio和Nanopore三种测序技术,并提取了粉尘螨虫卵DNA,最大限度消除了螨虫体内消化道微生物基因组的污染,成功绘制出第一个粉尘螨基因组和转录精细图谱,达到染色体水平,并在世界过敏组织(The World Allergy Organization,WAO)举办的学术期刊The World Allergy Organization Journal在线发表论文,题目为Chromosome-level assembly of Dermatophagoides farinae genome and transcriptome reveals two novel allergens Derf37 and Derf39。

世界变态反应组织(WAO)成员来自104个地区和国家的变态反应学和临床免疫学协会,为全球近100个国家的会员提供变态反应学相关的医学教育推广计划、专题讨论会和讲座。此外,该研究还发现了粉尘螨新过敏原Derf37和Derf39,并获得世界卫生组织与国际免疫联合会下属的过敏原国际命名委员会(WHO/IUIS)正式命名。Derf39是迄今为止粉尘螨过敏原组分被WHO/IUIS正式编号排序最新的一个。


 
过敏性疾病是一类常见病和多发病。我国目前至少有500万以上儿童患过敏性哮喘、5000万以上过敏性鼻炎患者和3000万以上过敏性皮炎患者;全球过敏性疾病发病率和死亡率正逐年上升。临床上尘螨过敏患者超过一半。尘螨脱敏治疗是目前公认的唯一针对尘螨过敏病因的治疗方法。本研究绘制出全球首个染色体水平的粉尘螨基因组及其转录组精细图谱,这将为国内外变态反应学同行深入研究尘螨过敏提供学术基础,也为研制我国本地化的尘螨脱敏疫苗和诊断试剂奠定了技术基础。

2013年深圳大学医学部吉坤美教授以第一作者发现粉尘螨过敏原Derf24,这是我国科研人员第一次获得WHO/IUIS正式命名的尘螨过敏原(http://www.allergen.org/viewallergen.php?aid=772)。2019年吉坤美/陈家杰课题组发现了Derp24过敏原蛋白N端32个氨基酸肽段与尘螨过敏患者血清特异性IgE呈强阳性反应(Clin Transl Allergy, 2019,9:28.)。

WHO全球防治慢性呼吸道疾病联盟主席和全球防治哮喘倡议组织主席Jean Bousquet教授发表评论,肯定了这项研究工作(Clin Transl Allergy ,2020,10:56)。上述研究获得了两项国家自然科学基金的资助(No.81571570、No.82071806),在此表示感谢。该课题组还将继续努力,力争在尘螨过敏这一细分研究领域获得更多的原创性发现,引领该领域的学术进步。

全文链接:https://www.sciencedirect.com/journal/world-allergy-organization-journal/vol/14/issue/10
WHO/IUIS命名Derf37链接:http://www.allergen.org/viewallergen.php?aid=960  
WHO/IUIS命名Derf39链接: http://www.allergen.org/viewallergen.php?aid=957


 

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