新技术使植物病原体全基因组的快速测序成为可能

　　

下一代测序技术使植物疾病的快速诊断比以往任何时候都更容易。美国农业部植物保护和检疫项目的植物病理学家Yazmín Rivera说:“看到测序技术的发展，以及这种新技术如何在如此短的时间内促进整个基因组测序，真是令人兴奋。”他最近发表了一篇关于牛津纳米孔技术协议效力的研究论文。

Rivera解释说:“我们希望对长读测序技术和协议提供一个公正的评估。”里维拉和其他植物病理学家一起，利用该公司的协议，分别从病毒感染的植物材料和植物病原细菌中制备RNA和DNA文库。经过一个小时的数据测序，科学家们有了足够的数据来组装小基因组。

里维拉说:“诊断专家们将欢迎对这项技术进行客观的评估。”Rivera和她的同事们在《植物健康进展》杂志上发表了他们的发现，并列比较了不同的方案，使读者能够确定哪种图书馆准备工具包最适合他们的需要。

快速获得生物体的整个基因组的能力对植物病理学领域具有重大意义。里韦拉解释说:“有了更多的现成信息，有助于识别新出现的病原体和难以识别的病原体。”

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<a href="https://apsjournals.apsnet.org/doi/full/10.1094/PHP-02-20-0013-RS" target="_blank" Comparison of Nanopore Sequencing Protocols and Real-Time Analysis for Phytopathogen Diagnostics