Science发布首张野生动物肠道微生物群图谱

在这项研究中，我们从野外近200种动物中收集了肠道微生物群，涵盖了不同的类别，摄食行为，地理位置和特征，覆盖了1200多种细菌物种——其中75%前所未知！

　　

 

   

图片:在福克兰群岛，的研究人员望向远方，而年幼的王企鹅则看向另一边。

Wild Biotech是一家临床前阶段药物发现和开发公司，今天宣布其第一篇主要论文发表，该论文发表在“Science”杂志上。该研究以前所未有的规模绘制了野外动物的肠道微生物群，为该公司已经庞大的数据库增加了数百万种潜在的基于微生物组的人类疾病治疗药物。Wild将使用这些发现首先挖掘其数据库中炎症，免疫和胃肠疾病的目标。

“在这项研究中，我们从野外近200种动物中收集了肠道微生物群，涵盖了不同的类别，摄食行为，地理位置和特征，”Wild Biotech的联合创始人兼首席执行官Neta Raab说。“使用从头宏基因组组装，我们构建并功能注释了来自这些动物的5000多个微生物基因组的数据库，覆盖了1200多种细菌物种——其中75%前所未知！”

非凡的生存壮举。鬣狗等食腐动物抵抗病原体感染和有毒食物，同时保持对疾病的免疫力的部分原因可能是它们的肠道微生物群。虽然对这些生态系统内多样性和功能的理解很差，但动物微生物群的微生物组成，多样性和功能含量与动物分类学，饮食，活动，社会结构和寿命有关，”Raab说。“这些都是我们可以利用的线索，以发现治疗人类疾病的全新药物。”

《Science》杂志报道的发现为野生动物微生物群的独特数据库增加了3000万个基因-每个基因代表一种潜在的新治疗剂-现在该数据库包含数百种动物物种和1亿个基因。Raab说，大部分基因组材料都是新颖的，我们的数据库将数千种以前未描述的物种引入到细菌生命树中。

Wild应用尖端的AI工具来破译其数据库的治疗潜力，并识别对人类疾病目标具有直接活性的蛋白质，肽，噬菌体和其他药物。该公司的数据库是独一无二的，因为与海洋或土壤中发现的微生物不同，动物的肠道微生物群是最相关的，可直接转化为人类治疗药物。

Wild Biotech的数据库和AI工具辅以高通量合成生物学，以验证微生物组衍生的药剂并将其加速到临床前测试中，并且从微生物基因组中提取的高质量数据使公司能够直接合成和测试药剂。例如，在科学研究中，该团队合成了一组以前未描述的来自腐肉食用菌微生物群的酶，并表明它们对一系列微生物毒素起作用，这表明了一种机制，可以使腐肉解毒，以便宿主动物安全食用。

该公司还在其数据库中确定了2000多个CRISPR/Cas基因组编辑系统，其中约三分之一不属于任何已知的CRISPR/Cas家族。

 

“难治性疾病需要新的干预思考。与其他公司不同，Wild已经建立了革命性的方法和工具来探索其新颖的数据集，”制药行业领先专家兼Wild顾问John Baldoni博士说。“您必须拥有数据才能完成计算工作。由于其高度发展和相关的图书馆，他们能够在几天内快速查看数百万次互动，并筛选和定位逻辑治疗领域。Wild的方法可以将可翻译的工作流程从其微生物组数据转换为与复杂疾病相关的分子机制。”

 

Raab说：“我们正在平衡创新和临床证据，以筛选与人类疾病相关的特定目标的数百万次相互作用。我们对这个数据库中隐藏的用于识别治疗疾病的全新方法的巨大潜力感到非常兴奋。”

 

 

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科学论文:https://science.sciencemag.org/content/early/2021/03/24/science.abb5352

Wild Biotech是一家临床前药物发现和开发公司，引领合成宏基因组学和微生物源性治疗的新兴领域。这家由女性领导的公司整合了最先进的生物信息学和高通量合成能力，以发现治疗先导并加速它们进入临床开发。该公司得到了私人投资者Marius Nacht和风险投资基金TechBio的支持。