研究人员提供了癫痫和自闭症相关基因的完整临床研究

研究人员对400多名scn2a相关疾病患者进行了完整的遗传和临床分析，这种疾病与包括癫痫和自闭症在内的多种神经发育障碍有关。通过将临床特征与基因异常以一种标准化的形式联系起来，研究人员希望他们的发现能够改善识别和临床干预。

　　

2021年3月17日费城儿童医院的研究人员编制一个对400多个SCN2A-related障碍病例完整的遗传和临床分析,这些病例与多种神经发育障碍,包括癫痫和自闭症有关。通过将临床特征与基因异常以一种标准化的形式联系起来，研究人员希望他们的发现能够改善识别和临床干预。

这项研究发表在医学遗传学杂志的网站上。

SCN2A基因的致病变异可导致多种与神经发育障碍相关的临床特征或表型。一些研究已经描述了从这个基因中有致病变化的个体收集到的遗传信息。然而，虽然遗传信息是以标准化的方式收集的，表型数据却没有标准化，而且在本研究之前，这些患者的临床特征的现有数据还没有被彻底分析，这意味着这些患者的基因型和表型之间的许多相关性往往只是臆断。

为了正确地将遗传数据和表型数据联系起来，CHOP的研究人员利用了人类表型本体论(HPO)，这是一种标准化患者临床特征的方法，并允许数据类似于遗传数据进行翻译。

“利用HP并基于我们以前的工作,我们知道我们有机会提供完整的研究数据和临床表型的SCN2A-related障碍分析,“Ingo Helbig说,医学博士,主治医生和首席研究员。“SCN2A变异个体表现出各种各样的临床特征，其中一些在我们的研究之前很难轻易归类。”

研究人员提取了近20年来发表的scn2a相关疾病的表型信息，包括2001年至2019年医学文献中对该疾病的每种描述，以及ENGIN跟踪的患者。在413个不相关的个体中，研究小组得出了总共10860个HPO术语的临床注释，总共562个独特术语。这使得研究人员能够将临床特征与特定的基因变异联系起来。

例如，蛋白质截断变异，即缩短基因编码序列的遗传变异，与自闭症和行为异常有关。错义变异，或遗传密码的改变，导致产生一种不同于正常预期的氨基酸，与新生儿癫痫发作有关。通过使用主成分分析来简化数据的复杂性，研究人员发现三个主成分占了数据集中三分之一的表型变异，强调尽管数据很复杂，但可以得到信息丰富的临床组。

“scn2a相关疾病是一组对可计算表型进行系统映射的疾病。我们的发现有助于定义scn2a相关疾病的亚类，这可能为未来精准医学方法帮助这些个体铺平道路，”Helbig说。“这项工作建立在我们之前的研究基础上，现在提供了一个框架，关于HPO术语如何在各种罕见疾病中映射复杂的临床数据，以得到关于临床特征、自然病史和结果的答案，我们还没有得到。”

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这项工作得到了哈特韦尔基金会、国家神经疾病和中风研究所通过奖K02NS112600 Channelopathy-associated研究中心通过奖U54NS108874,尤尼斯肯尼迪施莱佛国立儿童健康和人类发展研究所通过奖U54HD086984,校内基金通过女士,全国医学转化中心通过奖UL1TR001878美国国立卫生研究院,转化医学研究所和治疗跨学科的项目在宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院,EuroEPINOMICS-Rare癫痫综合征财团,德国研究基金会通过赠款HE5415/3-1 HE5415/5-1, HE5415/6-1, WE4896/3-1, DFG / FNR国米研究组通过奖励we4896/4 FOR2715 - 570 1, HE5415/7-1,和国米/脱硫/ 17/11583046,基因组学研究和创新网络,ELIXIR-Luxembourg,国际抗癫痫联盟,Ruth L. Kirschstein国家研究服务奖机构研究培训拨款(T32 NS091008)，以及Wellcome Trust 4ward North Clinical PhD Academy through Award 203914/Z/16/Z。

Crawford等人，“scn2a相关疾病个体的10860个表型注释的计算分析。”geneet Med，在线，2021年3月17日。DOI: 10.1038 / s41436 - 021 - 01120 - 1。#

关于费城儿童医院:

费城儿童医院成立于1855年，是美国第一家儿科医院。通过其长期致力于提供卓越的患者护理，培训新一代儿科医疗保健专业人员，以及开创性的重大研究倡议，儿童医院培育了许多有益于世界各地儿童的发现。它的儿科研究项目是全国最大的。此外，其独特的以家庭为中心的护理和公共服务项目使这家拥有595张床位的医院成为儿童和青少年的主要倡导者。欲了解更多信息，请访问http://www.chop.edu。