生命与海洋科学学院刘琳/高雷课题组在《Plant Physiolog…

　　

近日，《Plant Physiology》（中科院1区，影响因子8.34）在线发表了深圳大学生命与海洋科学学院刘琳和高雷课题组合作发表，题为“TRANS-ACTING SIRNA3-derived short interfering RNAs confer cleavage of mRNAs in rice”的研究论文。

植物Small RNA是一类长度为21 nt- 24 nt的小片段RNA，在植物的生长、发育、生殖以及逆境响应等过程中发挥重要的调控作用。植物TRANS-ACTING SIRNA3 (TAS3)-来源的siRNA主要包含经典的tasiR-ARF和non-tasiR-ARF siRNA，tasiR-ARF的功能在植物中是保守的，然而non-tasiR-ARF siRNA的产生和功能却是未知的。该研究通过在水稻中进行系统的分析，发现TAS3来源的siRNA中，tasiR-ARF只占全部siRNA的2%，而non-tasiR-ARF siRNA占绝大部分。进化分析显示non-tasiR-ARF siRNA 在禾本科中具有保守性，尤其在稻属植物中高度保守；利用膜结合核糖体的降解组文库及高通量测序分析，发现tasiR-ARF除了靶向经典的ARF基因以外，还同时靶向重金属胁迫的新型靶基因；此外，发现non-tasiR-ARF siRNA也具有大量潜在的靶基因，这些靶基因显著富集于化学信号刺激途径，通过创制水稻TAS3a-c突变体对这些靶基因进行了遗传分析和实验验证。

该研究系统分析了水稻TAS3来源的siRNA的起源与进化，利用膜结合核糖体降解组测序的手段鉴定了一系列新型靶基因，揭示了TAS3来源的siRNA在水稻生长发育和逆境胁迫适应中具有广泛的调控功能。

深圳大学博士研究生罗淋淋为本论文的第一作者，高雷和刘琳副教授为该论文的通讯作者，深圳大学为本论文的第一单位，该研究得到了国家重点研发计划（2019YFA0903900）和广东省创新团队（2014ZT05S078）等项目的资助。

论文链接：https://academic.oup.com/plphys/advance-article/doi/10.1093/plphys/kiab452/6373381