国际团队联合中国科学家开发新病毒“Google”地图

一个国际科学家团队创建了一个强大的新资源，以加快疫苗和治疗方法的开发，以抗击下一次大流行。

　　

弗吉尼亚大学医学院的研究员Wladek Minor博士和中国和波兰的合作者开发了一个互联网信息系统，名叫virusMED，它列出了我们所知道的800种病毒株的原子结构和潜在的脆弱性，包括75个不同的病毒家族，包括SARS COV-2、流感、埃博拉和HIV-1。包括首席研究员Heping Zheng在内的几位合作者都曾是Minor实验室的学生和成员。

这种新的潜在威胁蛋白质全景图将帮助科学家快速有效地应对下一种可能对人类造成严重破坏的病原体。Minor和他的合作者将该资源与Google地图进行了比较，因为它组织并注释了一种病毒的主要兴趣点，科学家可以将其用作药物和疫苗开发的路线图。

“与COVID-19的斗争尚未结束，但我们迫不及待地要开始为下一次大流行做准备。VirusMED是朝着先进信息系统迈出的一步，该系统汇集了具有不同专业知识的研究人员，以应对复杂的生物医学挑战，”Minor说。“virusMED中包含的信息将帮助来自多个学科的病毒研究人员，特别是从事药物设计或抗病毒治疗的研究人员。我们提供新颖的结构分析，并整合来自各种资源的相关信息，以提供蛋白质最重要和最脆弱区域的全面图片。”

病毒热点

通过迅速解开SARS-CoV-2病毒的作用机制，科学家们能够开发出安全有效的新冠病毒疫苗。新数据库旨在将这类关键信息放在一个方便的位置，让科学家触手可及。

VirusMED包含关于病毒种类和毒株、宿主、病毒蛋白质和抗体以及已获得美国食品和药物管理局批准的药物等重要科学数据的广泛信息。研究人员称病毒的兴趣点为“热点”，这些热点为药物和疫苗开发提供了强有力的起点。

Minor实验室的研究人员David Cooper博士说：“为治疗COVID-19而开发的一种最有希望的菌株无关抗体疗法利用这类信息改进了一种从2003年感染SARS病毒的幸存者身上分离出来的独特抗体。对快速的药物和疫苗设计感到惊讶的人没有意识到今天的研究人员是在几十年前的研究基础上进行的。”

Minor说，virusMED的主要优势之一是它将现有的病毒知识集中在一个位置。以前，这些数据分布在多个资源中，并且通常是“孤立的”，因此不容易访问。借助virusMED，研究人员可以通过病毒或他们感兴趣的热点浏览信息。

有关所有数据库的免费和可访问性，请访问https://virusmed.biocloud.top.

“我实验室的目标之一是制造其他科学家可以使用的工具。我们观察森林，并找到方法帮助其他人关注树木，”Minor说。“资源生成并不迷人，但科学的最终目标是让生活变得更好。该论文的一位匿名同行评论员声称，他们立即成为该系统的热情用户。我们希望virusMED能够真正发挥作用。”

这项工作得到了湖南省自然科学基金和中国国家自然科学基金的资助。Minor和Cooper得到了美国国立卫生研究院的国家普通医学科学研究所的资助，资助号为R01-GM132595。 

参考文献： “virusMED: an atlas of hotspots of viral proteins” by HuiHui Zhang, Pei Chen, Haojie Ma, Magdalena Woinska, Dejian Liu, David R. Cooper, Guo Peng, Yousong Peng, Lei Deng, Wladek Minorc and Heping Zheng, 28 September 2021, IUCr Journal.

DOI: 10.1107/S2052252521009076