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突破!组织来源外泌体做定量蛋白组学发表14分高水平文章
【字体: 大 中 小 】 时间:2020年09月22日 来源:吉凯基因
杂志:Journal of Extracellular Vesicles,IF=14.976;
实验室团队:哥德堡大学萨尔格伦斯卡学院的Jan Lötvall教授团队,Jan Lötvall是世界著名的外泌体公司Codiak BioSciences Inc的首席科学家。
目前为止,大多数细胞外囊泡(EV)研究都是在细胞系上进行的,在体内如何很好地认识EVs的特性知之甚少。为了识别相关的基于EV的生物标志物和EV真正的功能,组织中衍生的EVs比从细胞系衍生的EVs更接近体内真实情况,因为细胞特性可能受到长期体外培养的影响,EVs的功能也可能受到影响。此外,肿瘤细胞系可能仍然不能代表体内产生的肿瘤。因此,从组织中分离和表征EV方面有一个重大的需求。本文建立了一套从组织中分离和表征EV的方法。
文章研究思路
从转移黑色素瘤组织中抽提获得外泌体,并进行进一步亚群区分,通过定量蛋白组学技术对不同亚群的外泌体进行蛋白差异表达谱分析。
图1. 外泌体亚群的抽提鉴定及生物学特性分析
图2. 不同亚群外泌体的蛋白表达差异
评论:常规的定量蛋白组学技术+肿瘤组织样本的外泌体亚群分析,之所以可以在JEV这类高分杂志上发表,关键在于组织来源外泌体+外泌体亚群分析,这两个突破点,这块是当前肿瘤学研究的空白和潜力价值挖掘点(参考单细胞测序、类器官培养等原理,组织外泌体具有更高的分析特异性)。
组织来源的外泌体好处多多,但组织样本应该怎么处理呢?
用什么方法获得的组织外泌体呢,和常规细胞上清中获得外泌体的方式有什么不同呢?
满足后续的蛋白组学实验需要多少组织样本呢?
其实,想要研究组织外泌体的老师,不用担心,从组织样本的前处理到外泌体的分离、鉴定,再到蛋白质组分析,吉凯基因均有专业的团队为您服务。
先来看看吉凯基因从黑色素瘤组织中获得外泌体情况吧:
一、样本信息(3生物学重复)
样本类型 |
保存状态 |
样本量 |
获得的外泌体量 |
黑色素瘤组织1 |
冻存 |
0.5g |
满足鉴定和蛋白组学实验 |
黑色素瘤组织2 |
冻存 |
0.5g |
满足鉴定和蛋白组学实验 |
黑色素瘤组织3 |
冻存 |
0.5g |
满足鉴定和蛋白组学实验 |
二、黑色素瘤组织外泌体的鉴定
NTA粒径分析,符合经典的外泌体尺寸大小
样本1
样本2
样本3
浓度:3.1E+11 Particles / mL
TEM透射电镜形态观察,符合经典的外泌体形态特征
WB 外泌体标志物检测
怎么样,心动不如行动,对组织外泌体有想法的快来吉凯基因吧,省心又省力,还等什么呢,快来吧!!!
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