你能区分新转录本和旧转录本吗？《Science》新技术告别一锅粥式检测

　　

Hubrecht 研究所（KNAW）的研究人员开发了一种监控基因转录物的生产和降解过程的新方法。3月6日《Science》文章报道细胞为了正常工作，动员了不同策略来控制转录副本的数量。

我们的身体由数亿万个细胞组成，这些细胞都含有相同的DNA。尽管所有细胞的DNA蓝图一样，但不同细胞类型的DNA活跃集团是不一样的。为了做到这一点，细胞需要先复制产生蛋白质的基因，这就是所谓的转录本。

创造与毁灭的平衡

细胞中各基因转录本数量是衡量基因活性的一个指标，但是这一数字与新产生的拷贝（转录）和销毁已经存在的拷贝（降解）两方面有关。在单细胞中，测量转录本需要裂解细胞，不能实时监测它随时间的变化。所以到目前为止，我们还不清楚单个细胞如何通过转录和降解调节特定转录本的拷贝数。

标记新副本

Hubrecht 研究所的Alexander van Oudenaarden、Hans Clevers和Marvin Tanenbaum通过开发一种新的单细胞测序技术区分新制作的转录本和已有的转录本，解决了这个问题。新方法被称为scEU-seq，可用于研究细胞发育过程的特殊化，健康系统与癌症系统的细胞分裂调节等。

独特的策略

通过将这些数据与计算机模型结合，研究人员发现转录和降解两个过程都与转录本数量密切相关。

“细胞似乎使用不同策略来调节基因活性。对某些基因来说，细胞必须能够非常迅速地改变拷贝数，这些基因的转录和降解都处于高水平，例如，细胞通过减少转录和增加降解，更快地改变拷贝数。”

原文检索：Sequencing metabolically labeled transcripts in single cells reveals mRNA turnover strategies. Nico Battich, Joep Beumer, Buys de Barbanson, Lenno Krenning, Chloé S. Baron, Marvin E. Tanenbaum, Hans Clevers, Alexander van Oudenaarden. Science 2020.

（生物通：伍松）