JAMA：新型冠状病毒可从哪些样本中检出？

　　

据世界卫生组织统计，目前新冠肺炎全球确诊病例已超过12万例，具备大流行特征。除了呼吸道标本，哪些标本也可能携带新型冠状病毒（SARS-CoV-2），这是大家都关心的。

中国疾病预防控制中心、北京地坛医院和青岛市疾病预防控制中心的研究人员本周在《美国医学会杂志》（JAMA）上发文称，在感染者的肺泡灌洗液、鼻腔、痰液、粪便和血液样本中可检测到SARS-CoV-2病毒，但在尿液中检测不到。

研究人员从205名新冠肺炎确诊患者中采集了1,070个样本，并利用RNA提取和实时定量PCR（RT-qPCR）来寻找新型冠状病毒的序列。如果通过40个或以下的RT-qPCR循环可检测到病毒RNA，则样本被视为阳性。而且，RT-qPCR的循环阈值越低，病毒拷贝数就越高。

利用这种方法，研究人员从72个痰液样本（72/104）、5个鼻拭子样本（5/8）和126个咽拭子样本（126/398）中检测到SARS-CoV-2 RNA。尽管在72个尿液样本中未检测到病毒，但他们却从29%的粪便样本中检测到病毒（总共153个粪便样本）。

于是，研究人员尝试对4个粪便样本进行后续培养和电子显微镜分析，以寻找活病毒。他们认为这相当重要，因为一旦在粪便中发现活病毒，就意味着SARS-CoV-2可能通过粪便途径传播。

阳性率最明显的是支气管肺泡灌洗样本，这些样本是通过向支气管肺泡内注入生理盐水随后吸出而收集的。以这种方式收集的15个样本中，14个（93%）检测结果呈阳性。相比之下，利用纤维支气管镜刷获得的13个活检样本中，只有6个（46%）通过RT-qPCR检测出阳性。

根据研究人员的分析结果，在血液中很少发现这种病毒。对于307份血液样本，他们仅从1%的样本中检测到SARS-CoV-2病毒，也就是说，只有3份血液样本呈阳性。他们怀疑这些患者是全身感染。

研究人员指出，这项研究中患者的年龄从5岁到67岁不等，并于1月初到2月中旬在北京、湖北省和山东省的三家医院接受治疗。“在整个治疗期间都采集了血液、痰液、粪便、尿液和鼻腔样本，”他们解释说。

在这些患者中，大约19%患有严重疾病，而大多数被诊断出病毒感染的患者也出现了明显的症状，如发烧、疲劳和干咳。不过，作者告诫称，目前的结果并不能说明不同类型的阳性样本与患者症状或疾病严重程度之间的潜在关联，因为他们无法获得所有患者的详细临床数据。

研究人员总结道，“有必要对具有详细的时间和症状数据的患者以及从不同部位连续采集的样本进行进一步的调查”。（生物通 薄荷）

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Detection of SARS-CoV-2 in Different Types of Clinical Specimens

JAMA. Published online March 11, 2020. doi:10.1001/jama.2020.3786