无需多组学，肿瘤研究新突破

　　

在癌症基因组序列的突变信息被广泛研究之后，研究热点逐渐转向基因组的三维结构如何参与癌症的发生和发展。一直以来Hi-C技术在肿瘤三维基因组研究中功不可没。2015年乳腺癌[1]三维基因组学研究发现，肿瘤样本的染色体中部分A/B compartment结构发生转化，这些转化区域中的很多基因和癌症重要通路WNT相关；同年，前列腺癌[2]Hi-C研究发现，癌细胞中TADs结构增多，包含TP53基因座的片段缺失促进形成了新的TAD结构；2017年多发性骨髓瘤[3]Hi-C研究发现，癌症基因组上存在大量染色体之间的相互作用的热点，Hi-C数据可用于检测基因组拷贝数变异和推测染色质易位事件。

由于癌症基因组变异的复杂性，癌症三维基因组的研究目前还较少。Hi-C数据的分析和挖掘一直集中于构象鉴定和差异构象分析，远没有达到“物尽其用”的地步，加之近千万个细胞的建库起始量要求，极大限制了肿瘤样本的三维基因组学研究。

近期安诺优达成功研发并推出全新肿瘤Hi-C产品，致力于打造一个为肿瘤样本三维构象研究量身定制的一站式研究平台，集微量建库技术和肿瘤特异性构象分析于一体，为肿瘤样本的三维基因组学研究开拓了新视野。

新品亮点：

1.一万个细胞建库，珍稀样本的建库福音
肿瘤Hi-C产品低至1万个细胞建库，成功突破了样本量“高不可攀”的建库门槛，专业解决珍稀样本的Hi-C建库问题。

样本类型	悬浮细胞/文库	贴壁细胞/文库	新鲜组织/文库
常规样本	5×106	5×106	100mg
珍稀样本	5×104	5×104	10mg

2.无需多组学，染色体易位分析一网打尽
癌症中基因组重排事件不仅能改变染色体一维结构，而且也会改变相关基因区域的三维空间结构。肿瘤Hi-C钞票，无需多组学，仅基于Hi-C数据，实现染色体间易位事件（Inter-Translocation）检测和所有染色体间互作信号的热图展示。

 
染色体间易位分析图

3.构象差异分析，肿瘤样本专属套餐

1）IDE模块—多方位分析肿瘤样本顺反式互作强弱
染色质相互作用的强度随距离而衰减，肿瘤Hi-C产品的分析策略中，通过IDE等分析，从多角度解析肿瘤样本染色质顺势互作强度的变化。

  IDE模块结果展示图

2）Delta_HiC 模块--差异分析可视化，差减之后结果更清晰

癌症细胞系相对于正常样本来说，基因组重排事件的发生对染色体位点间的互作有着重要影响。Delta_HiC分析通过样本间的互作矩阵差减，解析肿瘤样本的特异性互作。

 

样本间不同位点互作的差异构象图

3）TAD 模块--挖掘肿瘤样本特异TAD结构

通过TAD边界滑动分析，定位肿瘤样本中任意新形成的TAD边界和消失的TAD边界，将特定区域TAD可视化，实现“想分析哪里就展示哪里”的个性化需求。

 
TAD分析结果展示图

4）A/B Compartment 模块--肿瘤样本A/B组分差异可视化

通过多种形式展示A/B组分差异，发现肿瘤样本A/B组分的变化情况，通过统计分析或图片展示，用多种结果形式展示分析结果。

 A/B Compartment 模块结果展示图

新品促销
即日起至2019年4月30日，安诺基因肿瘤Hi-C产品，包含建库测序分析全套服务内容，统一八五折！感兴趣的老师们可关注安诺基因公众号（annuogene)进行咨询。

参考文献：
[1] Barutcu AR, Lajoie BR, Mccord RP, et al. Chromatin interaction analysis reveals changes in small chromosome and telomere clustering between epithelial and breast cancer cells[J]. Genome Biology, 2015, 16 (1) :1-14
[2] Phillippa C. T, Joanna AK, Aaron T.L. L, et al. Three-dimensional disorganization of the cancer genome occurs coincident with long-range genetic and epigenetic alterations[J]. Genome Biology, 2015.26:719–731.
[3] Wu P, Li T, Li R, et al. 3D genome of multiple myeloma reveals spatial genome disorganization associated with copynumber variations[J]. Nature Communications, 2017, 8 (1).