中科院海洋研究所李鹏程组:联合蛋白质组学和转录组学技术
鉴定白色霞水母刺蜇相关的毒素

【字体: 时间:2017年10月02日 来源:联川生物

编辑推荐:

  近几十年来,水母蜇伤已成为威胁全球沿海地区人类健康和安全的严重问题。为进一步了解水母毒液组成,本研究利用转录组学和蛋白质组学整合分析技术对白色霞水母切除新鲜触手组织毒液的组成进行了分析。

  

近几十年来,水母蜇伤已成为威胁全球沿海地区人类健康和安全的严重问题。每年都会有数十万人被蜇伤,受害者将面临严重的痛苦,如瘙痒,肿胀,炎症,风疹甚至更严重的后果。白色霞水母是中国沿海广泛分布的一种含毒素水母。目前尚不清楚水母毒液中存在多少种类型的毒素,因此全面了解水母毒液组成,有助于有效治疗水母蜇伤。

为进一步了解水母毒液组成,本研究利用转录组学和蛋白质组学整合分析技术对白色霞水母切除新鲜触手组织毒液的组成进行了分析。

转录组学分析数据共获得4,608,524条reads;de novo组装后共得到40,434个unigenes。蛋白质组学分析数据中,总共产生了311,635个MS / MS光谱以及12,247个独特MS / MS光谱,最终鉴定到1556个同源蛋白质。确定了174种潜在的毒素蛋白质,其中27种蛋白质与有毒动物的毒素同源,包括磷脂酶A2,锌金属蛋白酶—整合素Agkistin,丝氨酸蛋白酶抑制剂,plancitoxin-1,阿特拉斯毒素Lt1a等。

本研究首次研究了白色霞水母的转录组学和毒液蛋白质组学。研究结果对白色霞水母毒液组成有了一个比较全面的了解。此外,本研究结果也可能对新生物活性蛋白的发现以及对水母蜇伤的有效治疗的发展非常有帮助。


 
图 四种水母的毒素蛋白质比较

参考文献
Li R, Yu H, Yue Y, et al. Combined proteomics and transcriptomics identifies sting-related toxins of jellyfish Cyanea nozakii.[J]. Journal of Proteomics, 2016, 148:57.

本研究中iTRAQ蛋白质组学分析服务由联川生物提供

联川生物为研究人员提供从miRNA鉴定到靶基因功能分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例,请访问www.lc-bio.com或拨打咨询热线0571-87662413
 
关于联川生物
联川生物成立于2006年,经过多年的快速发展,已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台,可以为科研用户提供从基因组,转录组,到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一,联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组,可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求,联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线,为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来,联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作,助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾1000篇高水平研究论文,其中已在Cell,Nature,Science系列顶级期刊上发表论文30余篇。

相关新闻
生物通微信公众号
微信
新浪微博
  • 搜索
  • 国际
  • 国内
  • 人物
  • 产业
  • 热点
  • 科普
  • 急聘职位
  • 高薪职位

知名企业招聘

热点排行

    今日动态 | 人才市场 | 新技术专栏 | 中国科学人 | 云展台 | BioHot | 云讲堂直播 | 会展中心 | 特价专栏 | 技术快讯 | 免费试用

    版权所有 生物通

    Copyright© eBiotrade.com, All Rights Reserved

    联系信箱:

    粤ICP备09063491号