中国科学家4月参与发表多篇Nature文章

　　生物通报道：4月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表，其中包括全球贸易活动中隐含的PM2.5跨界污染的健康影响，酿酒酵母染色质重塑蛋白SWI2/SNF2与核小体结合的冷冻电镜结构，以及柑橘“多胚”形成的分子基础等。

首先来自清华大学，北京大学，加州大学欧文分校等处的研究人员以两种不同方式分别计算各个地区和大气污染相关的死亡人数：1）和该地区产生的污染相关的死亡；2）和该地区消耗的商品和服务相关的污染相关的死亡。1）包括和污染排放相关本地人死亡和因大气流动而受影响的其他地区（包括其他大陆）的相关死亡，2）则指该地区消费的商品和服务所属的原产地在生产过程中造成的污染相关的死亡。

新研究将全球划分为13个区域，发现与国际贸易相关的PM2.5跨界污染水平远高于与长距离大气输送相关的跨界污染水平。国际贸易隐含的PM2.5跨界污染在2007年造成全球约76万人过早死亡，约占全球因PM2.5污染造成的过早死亡人数的22%。而同期研究估算的与PM2.5长距离输送相关的过早死亡人数为41万人。研究人员使用四种计算模型，并用独立数据辅助检验，评估了2007年全球345万与PM2.5污染相关的过早死亡案例。结果表明，其中约12%（441,100）与死亡发生地之外排放的污染物相关，约22%（762,400）与本地生产但异地消费的商品和服务相关。其总数超过100万。2007年中国产生的PM2.5污染和中国以外地区的64,800例死亡相关，而西欧和美国的商品和服务消费与中国的108,600例死亡相关。

同样来自清华大学生科院，蛋白质科学教育部重点实验室等处的研究人员在Nature杂志上报告了酿酒酵母染色质重塑蛋白SWI2/SNF2与核小体结合的冷冻电镜结构，这将为解析染色质重塑机制提供重要的信息。

研究人员通过冷冻电镜单颗粒技术，成功获得了Snf2-nucleosome 分辨率为4.69 Å的电镜结构。通过对比本实验室之前解出的Snf2蛋白的晶体结构和复合物的电镜结构发现，Snf2蛋白结合核小体以后，两个主结构域( core1 and core2)之间发生了约80°的旋转。这个巨大的构象变化产生了一个由SuppH helix和Brace helix介导的相互作用的新界面，同时把motif VI (arginine fingers)和motif I (P-loop)拉到一起，这就揭示了核小体能够激发Snf2蛋白ATP酶活的机理。与人们以前一直认为的Snf2是插到DNA与组蛋白之间发挥功能的模型不同，结果显示，Snf2主要通过多个保守的解旋酶motif和核小体DNA的磷酸骨架结合，这也解释了染色质重塑复合物与DNA结合的序列非特异性，同时也揭示了一个普遍的染色质重塑蛋白与底物结合的机制。

研究指出， Snf2蛋白打破局部的DNA与组蛋白的相互作用，使结合位点处的DNA发生形变。该研究推断，ATP结合和水解，使得Snf2发生进一步结构改变，从而把这个DNA形变推送出去，这与文献中染色质重塑的”DNA波”模型一致。这个研究解析了第一个染色质重塑蛋白与底物核小体结合的高分辨结构，首次揭示了染色质重塑的机理。清华大学“****”教授最新发表Nature文章

此外，华中农业大学的研究人员以柑橘原始种、野生种和栽培种的基因组为基础，采用比较基因组、遗传学和转录组等方法解析了柑橘“多胚”形成的分子基础，锁定了关键基因CitRWP。

研究人员利用柑橘基因组平台优势结合前期构建的遗传群体，针对性设计了极端表型混池测序和局部基因关联分析的策略，将柑橘多胚位点定位到一段80-Kb的区域，包含11个候选基因。进一步精细剖析发现候选基因CitRWP与多胚性状的关联程度最高，并表现出胚珠特异表达的特点，且在多胚的表达显著高于单胚。在多胚柑橘品种中，该基因启动子区域有MITE（Miniature Inverted-repeat Transposable Element）转座子插入，并在786份自然变异资源中与多胚性状完全共分离。

这项研究完成了四个柑橘代表种的基因组，利用单分子测序技术（PacBio）构建了迄今为止最为完整的柑橘基因组，其中Contig N50为2.2 Mb，是已经报道的柑橘基因组的18倍以上。基因组比较分析发现柑橘品种特有的基因组区段大部分为重复序列及未知功能的基因，大约有1/5的基因已知功能并富集在抗性、蛋白水解及果胶裂解等生物学途径。本研究进一步对本室搜集的100份代表原始、野生和栽培柑橘进行深度测序并群体比较，分析表明原始柑橘的遗传多样性最高，栽培柑橘中的生殖和能量代谢相关的基因受到了选择。
（生物通：万纹）