上海交大，中科院发表Cell Res文章：三维基因组组装重要新机制

　　

来自上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心，中科院北京生物物理所的研究人员发表了题为“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章，阐明了染色质架构蛋白CTCF方向性识别原钙粘蛋白启动子和增强子位点的分子机制，为进一步研究CTCF在三维基因组组装过程中的功能奠定了重要基础。

这一研究成果公布在Cell Research杂志上，文章通讯作者为上海交大吴强教授和中科院北京生物物理所王艳丽研究员。

CTCF蛋白属于锌指蛋白家族，具有11个串联排列的锌指结构。CTCF通过其不同组合的锌指结构结合到人类基因组中的很多位点上，并介导染色质环化和染色质高级拓扑结构的形成，在染色质折叠组装、基因表达调控、DNA断裂修复等生命过程中起到十分重要的作用，CTCF及其基因组结合位点的突变与肿瘤等多种疾病息息相关。

CTCF在人类基因组中有成千上万个结合位点，然而CTCF如何判别，如何结合这些非常多样又高度相似的基因组位点仍然不清楚。吴强课题组前期在CTCF调控基因表达和染色质高级结构组装方面进行了一系列研究工作，发现CTCF通过方向性结合原钙粘蛋白基因的启动子和增强子，引起原钙粘蛋白特异启动子与增强子的方向性环化，进而在三维染色质高级拓扑结构中相互靠近，并决定原钙粘蛋白启动子的选择。

这项研究工作对于了解CTCF结合其基因组位点的方向性、多样性、灵活性、适应性、动态性和保守性等方面具有重要启示。

原文标题：

Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites