四川农业大学发表基因组测序重要研究

　　

生物通报道：重测序揭示基因变异存在一定的局限，因为这种方法只能检验与参考基因组类似的序列。然而参考基因组往往是不完整的，也不能完全反映物种的遗传多样性。日前，四川农业大学的研究人员通过全基因组从头测序对猪（Sus scrofa）进行了更全面的遗传分析。这项研究于九月十九日发表在Genome Research杂志上，文章第一作者和通讯作者是四川农业大学的李明洲（Mingzhou Li）教授。

研究人员从头组装了欧亚大陆九种猪的基因组，这些猪在地理分布和表型上很有代表性。他们将自己获得的基因组序列与猪参考基因组进行比较，发现了大量新的SNP和结构变异。研究人员还为猪参考基因组补上了137.02 Mb的序列，这段序列包含1737个蛋白编码基因。这项研究展示了全基因组从头测序的力量，为人们提供了宝贵的遗传学资源，有助于在农业生产和生物医学研究中更有效的利用猪。

九月五日，浙江大学和Nebraska大学的科学家们在Nature Genetics杂志上发布了异源多倍体芥菜型油菜（Brassica juncea）的基因组序列。油菜在植物分类上属于十字花科芸薹属（Brassica genus），是世界广泛种植的油料作物。这类植物拥有三个二倍体基因组和三个异源多倍体基因组。这篇文章的通讯作者是浙江大学的张明方（Mingfang Zhang）教授和Nebraska大学的Sally A Mackenzie。（更多详细信息参见：浙江大学Nature Genetics发表基因组测序新成果）

人类基因组是包含六十多亿DNA碱基的复杂序列。现在测序一个人的基因组已经比较方便了，但随之而来的基因组分析问题依然令人头疼。为了提高基因组分析的质量，澳大利亚Garvan医学研究所的团队开发了Sequins技术。他们在八月八日的Nature Methods杂志上连发两篇文章对这个技术进行了详细的介绍。（更多详细信息参见：两篇Nature Methods发布突破性测序技术）

今年七月，暨南大学和南加州大学的研究人员通过长读取测序技术从头（de novo）装配了一个高质量的中国人基因组。这项研究成果发表在Nature Communications杂志上，文章通讯作者是南加州大学Kai Wang教授、暨南大学粤港澳中枢神经再生研究院的苏国辉（Kwok-Fai So）教授和周立兵（Libing Zhou）教授。（更多详细信息参见：暨南大学Nature子刊发表重要测序成果）

作者简介：

李明洲 四川农业大学 博士，教授，博士生导师，研究生院副院长。获国家百千万人才工程人选、国家有突出贡献中青年专家、四川省学术技术带头人、四川省有突出贡献的优秀专家、四川省青年科技奖、四川省优秀教师、北大-清华生命科学联合中心 “ 杰出博士后”等荣誉称号。现为中国农业生物技术学会理事,《遗传》杂志编委,科技部战略研究课题组顾问专家,四川省青年科技创新研究团队带头人,四川省2011协同创新中心“川猪产业升级与猪肉安全”研究骨干和教育部“****和创新团队发展计划”创新团队研究骨干。

教育背景及工作经历：1999.09-2003.07 四川农业大学，本科；2003.09-2008.06 四川农业大学，博士；2008.09-2010.12 四川农业大学动物科技学院，讲师；2011.01-2012.12 四川农业大学动物科技学院，副教授/研究室主任；2012.06-2013.06 北京大学（BIOPIC研究中心），博士后；2013.07-2014.06 北京大学（北大-清华生命科学联合中心），博士后；2013.01-2015.06 四川农业大学动物科技学院，教授/研究室主任；2015.07-至今四川农业大学动物科技学院，教授/副院长。

生物通编辑：叶予

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