我科学家金丝猴测序成果刊登国际期刊

【字体: 时间:2016年08月24日 来源:生物通

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  在最近的一项研究中,中科院动物研究所的李明(Ming Li)研究员和诺和致源的李瑞强(Ruigiang Li)博士等人,已经测序、组装和分析了来自四个金丝猴濒危种的38只野生金丝猴的基因组突变。这项研究结果发表在国际分子生物学和进化领域的权威期刊《Molecular Biology and Evolution》。

  

生物通报道:异国情调和色彩斑斓的金丝猴,整日在中国、缅甸和越南山区森林的树梢上觅食。虽然这一濒危物种的分布一度曾非常广泛,但是仅限于片段化和高海拔(4500米)的山地森林,从而使得它们成为进化生物学家的一个吸引人的研究热点,来揭示隐藏在它们适应性背后的遗传学机制。

现有五个物种具有不同的人口普查规模,是公认的:R. roxellana,川金丝猴,共计约25000只;R. brelichi、灰金丝猴(800只);R. bieti,黑色或云南金丝猴(2000只);R. avunculus,超罕见的Tonkin金丝猴(200只)和R. strykeri,缅甸金丝猴(300只)。

在最近的一项研究中,中科院动物研究所的李明(Ming Li)研究员和诺和致源的李瑞强(Ruigiang Li)博士等人,已经测序、组装和分析了来自四个金丝猴濒危种的38只野生金丝猴的基因组突变(来自42只金丝猴的基因组图谱:27只金色、4只灰色、2只缅甸和9只黑色),这是类人猿之外的最大的灵长类动物基因组学研究。这项研究结果发表在国际分子生物学和进化领域的权威期刊《Molecular Biology and Evolution》。

相比较其他灵长类动物,他们在不同的金丝猴当中发现了相同数量的有害突变,以及减少的遗传多样性,这表明它们遭受了严重的种群瓶颈或可能的近亲繁殖。研究人员重建了它们在过去200万年的进化史,包括主要的气候冰川运动、地质(西藏高原隆起)和可能驱动种群隔离和种群分布的消退。

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在一个物种——黑色金丝猴中(在野外发现了约2000只),他们发现了一些低氧相关基因,可让它们比其他任何非人类灵长类动物能够在最高海拔繁衍(在长江和湄公河之间的狭窄区域,海拔高度3400米至4500米)。尽管要面对低温、缺氧和在冬季的冷冻温度中寻找食物的相关挑战。

这项研究首次仔细分析了这种濒危的灵长类动物,揭示了这种罕见的灵长类动物的遗传多样性、人口分布和适应性。

李明研究员主要从事濒危灵长类保护生物学领域的相关研究。研究兴趣主要集中在我国濒危灵长类(以疣猴亚科为主)的保护基因组学、进化生物学、行为生态学等方面。在有关金丝猴等疣猴亚科的演化历史、谱系格局、适应性进化、行为生态以及保护管理等方面进行了深入的研究。

2014年11月,李明课题组和诺禾致源共同合作,在国际上率先完成了金丝猴的基因组序列图谱的构建,为解析金丝猴适应植食性的分子机制、系统发育和进化提供了遗传基础,该研究成果于2014年11月2日在线发布于国际著名期刊Nature Genetics上。相关阅读:Nature Genetics:中国科学家破译金丝猴基因组川金丝猴基因组测序完成动物所等揭示金丝猴植食性适应分子机制及其进化历史

(生物通:王英)

注:李明,男,1966年出生,汉族,安徽省宁国市人,理学博士,研究员,博士生导师,中国农工民主党党员。中国科学院动物研究所灵长类生态学研究组组长。1988、1991和1996年于安徽大学和华东师范大学分获学士、硕士和博士学位。1999年在中国科学院动物所完成博士后研究工作。1999年至2001年在日本从事分子系统地理学和保护遗传学的博士后研究,2002年先后受英国皇家学会和日本学术振兴会资助以高级访问学者身份在英国和日本从事合作研究。主要从事濒危灵长类保护生物学领域的研究。研究兴趣主要集中在我国濒危灵长类(以疣猴亚科为主)的分子生态学、进化生物学、保护遗传学、种群基因组学、行为生态学等方面。在有关金丝猴的系统演化、谱系生物地理格局、保护遗传学、行为生态学以及保护管理等方面进行了深入的研究,至今已在Nat Genet、Mol Biol Evol、Mol Ecol、Conserv Biol等期刊发表论文100余篇,其中SCI论文近60篇。

生物通推荐原文:
Publication Title: Population Genomics Reveals Low Genetic Diversity and Adaptation to Hypoxia in Snub-Nosed Monkeys

 

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