南农大隆小华组：人参果会影响细菌群落的多样性和丰度吗？

　　

土壤养分和微生物群落是贫瘠环境中植被恢复的两个关键因素。生态化学计量学在生态系统的功能和局限性上起着重要的作用，但是，在典型的喀斯特地区，地上和地下化学计量学与细菌群落之间的关系尚不清楚。

南京农业大学隆小华课题组运用人参果研究土壤和植物之间的化学计量特征，并确定喀斯特地区土壤中细菌的多样性和丰度。研究结果表明，喀斯特地区土壤的pH值相对较高，肥力低，以及质地粗糙。叶片氮磷比与土壤氮、磷的相关性研究暗示氮限制。人参果的种植增加土壤中脲酶的活性，但降低过氧化氢酶的活性。研究人员运用基于Illumina的16S测序方法检测出人参果根际土壤比非根际土壤的细菌多样性更高。变形菌门、酸杆菌门、放线菌门和拟杆菌门为所有样本中的主要门类，占超过80%的reads。在属的水平，所有检测到的625个属均能在根际和非根际土壤中找到，其中，63个属在样本间表现出显著性差异。

 
图 土壤样本中不同细菌门类所占的比例

根际土壤的Shannon指数和Chao 1指数比非根际土壤更高，表明喀斯特地区人参果的种植增加了细菌群落的多样性和丰度。

本研究中的16S rDNA测序分析由联川生物协助完成。

用户文章
Hu JX, et al.（2016）Pepino (Solanum muricatum) planting increased diversity and abundance of bacterial communities in karst area. Scientific Reports. 6:21938. DOI: 10.1038/srep21938.

联川生物为研究人员提供从16S rDNA鉴定到微生物群落多样性分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打咨询热线0571-87662413
 
关于联川生物
联川生物成立于2006年，经过多年的快速发展，已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文22篇。