山东省医学科学院Cell子刊发表癌症新成果

　　

生物通报道  来自山东省医学科学院、北京化工大学、中国医学科学院等机构的研究人员，采用综合功能基因组学方法揭示出EPB41调节异常与肝细胞癌风险有关。这一研究发现发布在Cell出版社旗下的《AJHG》杂志上。

山东省医学科学院的杨明（Ming Yang）研究员是这篇论文的通讯作者。其研究方向包括肿瘤分子遗传学，包括肿瘤相关lncRNA功能鉴定、基于纳米载体的肿瘤基因治疗、肿瘤药物基因组学、肿瘤遗传易感性等等，已发表SCI论文74篇。

肝细胞性肝癌（HCC）是临床常见的恶性肿瘤之一，位于全球恶性肿瘤死因的第3位。慢性病毒感染、酒精性肝病、年龄、性别、糖尿病、家族史和种族等均与其发生和发展相关，是多因素、多基因突变的复杂病变过程。HCC早期诊断困难，生存期短。尽管一些全基因组关联研究(GWASs)提供了有关肝癌遗传学的许多重要见解。当前对于GWASs确定的许多易感单核苷酸多态性(SNPs)在癌症遗传可能性和促进癌症风险中的分子机制仍不清楚。一些新的研究策略，包括功能评估可确保系统地探究真正的因果遗传变异。

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在这项新研究中，研究人员开发了一种综合功能性基因组学方法，鉴别了整个基因组一些转录因子结合位点中的癌症易感性SNPs。通过综合来自c-Myc cistromics、1000 Genomes和TRANSFAC matrix的功能基因组数据，他们成功注释了c-Myc cistrome中的12个 SNPs，这些SNPs具有与调节HCC中c-Myc结合亲和力一致的一些特性。

在1,806名乙肝病毒（HBV）相关HCC患者和1,708名对照受试者中对这12 个SNPs进行基因分型后，研究人员在中国人群中鉴别出了一个HCC易感性SNP：rs157224G>T。这一多态性通过改变c-Myc介导的EPB41转录调控，促成了HCC易感性，风险rs157224T等位基因显示基因表达显著下降。

基于细胞增殖、创伤愈合、侵袭小室实验(Transwell assay)和小鼠移植瘤模型，研究人员在体内外确定了EPB41是一个HCC易感基因。与这一观点相一致，他们注意到相比正常组织，在HCC组织样本，尤其是门静脉转移灶或肝内转移灶中EPB41表达显著下降。

这些研究结果表明一些调控性遗传变异与HCC相关，并通过采用一种全基因组方法提供了有关这一恶性肿瘤发病机制的一些重要认识。

根据发表在2016年4月18日Nature Cell Biology杂志上的一篇研究论文，科学家们有可能发现了肝癌的一个重要的新诊断标志物。由德克萨斯大学MD安德森癌症中心领导的这项研究发现，叫做己酮糖激酶或果糖激酶（KHK）的一个基因在正常肝组织及肝肿瘤中呈差异性表达。研究结果揭示，相比于健康细胞，肝癌细胞中的果糖代谢水平明显降低(吕志民教授Nature子刊发布癌症代谢重要发现 )。

北京大学工学院的席建忠领导研究人员在新研究中证实，在人类和小鼠中miR-122靶向不同的TGFβ信号通路影响了肝癌转移。这一研究发现发布在2016年3月18日的Nature Communications杂志上(北大Nature子刊发布miRNA重要发现)。

研究人员在一项研究中发现了肝癌的“坏种子”，并相信将来有一天能够重编程它们对癌症治疗保持反应。这项研究发布在2015年12月24日的Cell Metabolism杂志上。NANOG在早期癌症中少见，但在III期肝癌中却有着丰富的NANOG。它通过重新连线细胞能量工厂——线粒体中的代谢促进了癌症扩散(Cell子刊靶向肝癌的“坏种子” )。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

Integrative Functional Genomics Implicates EPB41 Dysregulation in Hepatocellular Carcinoma Risk

Genome-wide association studies (GWASs) have provided many insights into cancer genetics. However, the molecular mechanisms of many susceptibility SNPs defined by GWASs in cancer heritability and in promoting cancer risk remain elusive. New research strategies, including functional evaluations, are warranted to systematically explore truly causal genetic variants. In this study, we developed an integrative functional genomics methodology to identify cancer susceptibility SNPs in transcription factor-binding sites across the whole genome……

作者简介：

杨明

2008年毕业于中国医学科学院北京协和医学院获肿瘤学博士学位。同年赴美国哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究所开展博士后研究。现任山东省肿瘤防治研究院基础研究中心常务副主任，分管山东省放射肿瘤学重点实验室。先后入选“国家863计划青年科学家”、“北京科技新星”、“北京市优秀人才”和“北京市青年英才”等人才计划。现兼任中国抗癌协会肿瘤病因学委员会委员、中国医促会医用生物材料分会秘书长、中国抗癌协会甲状腺癌专业委员会青年委员，受聘为SCI期刊《PLOS One》编委和《Advanced Functional Materials》、《Oncogene》等24份SCI期刊审稿人。

研究方向：肿瘤分子遗传学，包括肿瘤相关lncRNA功能鉴定、基于纳米载体的肿瘤基因治疗、肿瘤药物基因组学、肿瘤遗传易感性等等。

发表论文及专利：已发表SCI论文74篇，被引用达1300余次，个人H因子24。其中，通讯作者和第一作者SCI论文57篇，合计SCI影响因子270余分。通讯作者及第一作者SCI文章主要发表在《American Journal of Human Genetics》、《Journal of Clinical Oncology》、《PLOS Genetics》、《Human Molecular Genetics》和《JBC》等国际知名期刊上。参与编写论著4部（英文专著一部）。申请专利6项，已授权3项。