安徽医科大学Nature Genetics发布GWAS研究新成果

　　

生物通报道  来自安徽医科大学、伦敦大学国王学院、香港大学等处的研究人员报告称，他们对中国人和欧洲人进行了全全基因组关联荟萃分析，鉴别出了与系统性红斑狼疮相关的10个新位点。研究结果发布在7月11日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。

安徽医科大学的崔勇（Yong Cui）教授，伦敦大学国王学院的Timothy J Vyse教授，及香港大学的香港大学杨万岭(Wanling Yang)教授是这篇论文的共同通讯作者。崔勇教授的主要研究方向为遗传性皮肤病，特别是在系统性红斑狼疮和遗传性角化性皮肤病的诊断、治疗方面具备丰富经验。杨万岭教授则长期致力于遗传学，基因组学和生物信息学领域的研究。

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系统性红斑狼疮（SLE）是一种高度复杂的疾病，其发生受到遗传学（66%的遗传可能性）严重影响。SLE在不同种群间的发病率有着显著的差异，相比于非裔和亚裔个体，欧洲人的患病率要低3-4倍。近年来，全基因组关联研究（GWASs）改变了人们对于SLE遗传病因的认识，对欧洲人群的最大型研究（4,036个病例和6,959名对照）发现了41个常染色体位点的关联证据。同时，两项已发布的中国人群GWASs研究和针对亚洲人的一些后续研究在31个位点发现了关联，其中包括未在欧洲人中公布的11个位点。因此，在这两个种群中通过GWASs已定位了52个SLE疾病易感性常染色体位点。然而到目前为止，尚未有报道称完成了SLE全基因组的跨祖先（transancestral）研究。

在这篇新文章中，研究人员组合了来自中国（1,659个病例和3,398个对照）和欧洲（4,036个病例和6,959对照）种群的3个GWAS数据集。对这些研究进行荟萃分析，证实一半以上发布的SLE遗传关联存在两个种群中。对中国（3,043个病例和5,074个对照）和欧洲（2,643个病例和9,032个对照）受试者开展的一项复制研究发现了10个从前未报道的SLE位点。

这项研究提供了进一步地证据证实，大多数的SLE遗传风险多态性包含在两个种群的同一区域中。此外，比较风险等位基因频率和遗传风险评分表明在非欧洲人（包括亚洲人）中SLE患病率增高具有遗传基础。

精准诊断系统性红斑狼疮，是全球医学界一大难题。2016年，中南大学湘雅二医院医学表观基因组学湖南省重点实验室陆前进教授率研发团队，经三年努力研发出一种特异性高、敏感性强的系统性红斑狼疮新型诊断标志物，在国际上首次将对该疾病的诊断提升到基因水平。成果已申请我国和国际发明专利，有望随后应用于临床诊断中（中南大学陆前进教授研究组发文解析系统性红斑狼疮 ）。

当细胞死亡时，一种酶无法分解涌入血液中的DNA可能是红斑狼疮中炎症的主要驱动者。纽约大学Langone医学中心的研究人员将在小鼠和人类患者身上获得的研究结果发布在2016年6月9日的Cell杂志上（Cell发布重要免疫发现 ）。

一次偶然地观察小鼠的大小差异时，研究人员发现一个消化死细胞的过程——LC3相关吞噬作用(LAP)发生缺陷可能导致了一种红斑狼疮样的自身免疫性疾病。圣犹大儿童研究医院的科学家们将这项研究在线发布在2016年4月的Nature杂志上（Nature揭示重要免疫发现 ）。

（生物通：何嫱）

生物通推荐原文摘要：

Genome-wide association meta-analysis in Chinese and European individuals identifies ten new loci associated with systemic lupus erythematosus

Systemic lupus erythematosus (SLE; OMIM 152700) is a genetically complex autoimmune disease. Genome-wide association studies (GWASs) have identified more than 50 loci as robustly associated with the disease in single ancestries, but genome-wide transancestral studies have not been conducted. We combined three GWAS data sets from Chinese (1,659 cases and 3,398 controls) and European (4,036 cases and 6,959 controls) populations. A meta-analysis of these studies showed that over half of the published SLE genetic associations are present in both populations. A replication study in Chinese (3,043 cases and 5,074 controls) and European (2,643 cases and 9,032 controls) subjects found ten previously unreported SLE loci. Our study provides further evidence that the majority of genetic risk polymorphisms for SLE are contained within the same regions across both populations. Furthermore, a comparison of risk allele frequencies and genetic risk scores suggested that the increased prevalence of SLE in non-Europeans (including Asians) has a genetic basis.

作者简介：

崔勇

安徽医科大学研究生学院院长，安徽省学术和技术带头人，教育部新世纪人才，享受安徽省政府特殊津贴，兼任中华医学会皮肤性病学会全国委员、皮肤病数字化诊断学组组长、中国医师协会皮肤科医师分会全国委员、中华医学会医学伦理学分会青年委员、中国免疫学会临床免疫学分会青年委员，安徽省皮肤性病学会委员。主要研究方向为遗传性皮肤病，特别在系统性红斑狼疮和遗传性角化性皮肤病的诊断、治疗方面具备丰富经验，其他技术方向包括皮肤病数字化诊断和远程皮肤病学。承担国家自然科学基金3项、973子课题一项等。教育部科学研究项目一项、安徽省杰出青年基金一项等，获得第十一届中国青年科技奖和安徽青年科技奖。近年来发病SCI专业论文100余篇，担任两本国家级规划教材副主编，主编专著1部、参编3部。

杨万岭教授

美国明尼苏达大学药理学和生物信息学博士，香港大学李嘉诚医学院儿童与青少年医学系教授。

长期致力于遗传学，基因组学和生物信息学领域的研究。其实验室目前正应用下一代测序技术研究系统性红斑狼疮易感基因及寻找小儿单基因疾病的致病突变。同时还致力于开发一体化的工具来帮助我们更好地理解遗传和基因组数据，进行基因型与表型的相关性分析。