徐安龙教授最新Cell文章

　　

近日，国际著名学术杂志《Cell》杂志在线发表了中山大学生命科学学院徐安龙教授研究团队的一篇研究论文，研究团队发现了六亿年前RAG转座子的“分子活化石”，为“人类抗体重排机制的转座子起源假说”提供了最有力的证据。该研究成果题为Discovery of an active RAG transposon illuminates the origins of V(D)J recombination。黄盛丰教授、陶鑫博士、元少春教授为论文共同第一作者，徐安龙教授为论文通讯作者。

1979年，美籍日裔科学家Susumu Tonegawa(利根川进)团队在发现了人类抗体V(D)J重排机制，并创造性地提出了重排机制的转座子起源假说，1987年他因“抗体重排机制”获得诺贝尔医学和生理奖。他提出的“人类抗体重排机制的转座子起源假说”，激励了一代又一代学者去探求重排机制及其起源。过去四十多年，尽管围绕重排机制，特别是核心酶--抗体重排激活酶(RAG1/RAG2)的功能与调控研究，取得了许多重大进展，但假说本身却从未得到证实，成为困扰免疫学界的一个经典谜题。

人体的免疫系统分为两部分：先天的固有免疫和后天可改变的适应性免疫，抗体重排机制就是适应性免疫中，后天能应对无数病源侵害的最关键机制(例如疫苗的作用就是基于此机制)，正是其如此的重要性，寻找抗体重排机制起源的研究一直是免疫学研究的热点，从而激励着一代代免疫学家为之努力。在1979年Tonegawa发现了“抗体重排机制”之后，免疫学家们一系列的研究发现介导抗体重排机制的关键酶就是：重组激活基因RAG1和RAG2，但是RAG基因编码的是人体自身的蛋白，并非转座酶，因此，科学家自然要问：“RAG基因如何进入人和其他脊椎动物基因组并整合到适应性免疫系统介导V(D)J重排?” 该问题由此成为公认的适应性免疫起源的关键谜题之一。

为了破解为一迷题，徐安龙教授及其团队自从20年前从美国留学回国时，就将自己的研究由过去疾病相关的免疫研究转到人的免疫系统起源这一非常基础的科学问题上。他的团队首先选择了动物进化研究的活化石-文昌鱼作为核心研究对象，因为文昌鱼是揭开我们脊椎动物起源最关键的物种，并且在我国的青岛、厦门、湛江等沿海都有，为该研究提供了长期可依赖的资源优势。

经过十多年的研究，他的团队对多个高质量的文昌鱼基因组草图进行深度信息学分析，发现文昌鱼保留了大量古老的、在脊椎动物中早已灭绝的转座子超家族。其中一个DNA转座子家族正巧编码了RAG1/2的蛋白,并具有类似抗体基因重组信号序列RSS的末端反向重复序列TIR，他们将此基因命名为ProtoRAG，意为编码原型RAG的转座子。通过系统和深入的功能和机制研究，他们发现文昌鱼ProtoRAG就是人们长期搜寻的决定抗体重排机制的RAG转座子，也可以认为该转座子就是六亿年前RAG转座子遗留下来的“分子活化石”。

这一发现为人类抗体重排的转座子起源假说提供了最强有力和直接的证据，该转座子的发现还为未来利用重排机制设计新的免疫抗体和免疫基因提供了崭新的基因编辑思路和技术。从免疫学的大视野看,该发现将适应性免疫的起源由脊椎动物推前到无脊椎脊索动物文昌鱼，由此向前推进1亿年，将改写现行免疫学教科书关于适应性免疫起源的观点。

原文摘要：

Discovery of an Active RAG Transposon Illuminates the Origins of V(D)J Recombination

Co-option of RAG1 and RAG2 for antigen receptor gene assembly by V(D)J recombination was a crucial event in the evolution of jawed vertebrate adaptive immunity. RAG1/2 are proposed to have arisen from a transposable element, but definitive evidence for this is lacking. Here, we report the discovery of ProtoRAG, a DNA transposon family from lancelets, the most basal extant chordates. A typical ProtoRAG is flanked by 5-bp target site duplications and a pair of terminal inverted repeats (TIRs) resembling V(D)J recombination signal sequences. Between the TIRs reside tail-to-tail-oriented, intron-containing RAG1-like and RAG2-like genes. We demonstrate that ProtoRAG was recently active in the lancelet germline and that the lancelet RAG1/2-like proteins can mediate TIR-dependent transposon excision, host DNA recombination, transposition, and low-efficiency TIR rejoining using reaction mechanisms similar to those used by vertebrate RAGs. We propose that ProtoRAG represents a molecular “living fossil” of the long-sought RAG transposon.