浙江省农科院：联合分析鉴定菜用大豆冷胁迫响应miRNA及其靶基因

　　

冷胁迫是限制菜用大豆(Glycine max L.)产量和品质的主要因素。在全球范围内，目前针对响应冷胁迫的miRNA进行系统鉴定和功能性分析，用以阐释抗寒性的分子机制。

在这项研究中，浙江省农科院蔬菜研究所徐盛春研究团队选取菜用大豆叶片分别构建了两个独立的小RNA文库，并运用高通量Illumina Solexa系统进行测序。结果鉴定出434个已知miRNA和3个新miRNA。随机抽取35个miRNA通过qRT-PCR分析进行验证。此外，运用降解组测序鉴定这些miRNA的靶基因。结果898个转录本被确定为54个miRNA家族的靶基因，并被分为5类。更重要的是，确定了51个在冷胁迫和正常条件下差异表达的miRNA。这些miRNA的靶基因功能富集在氧化还原、信号传导、代谢过程。实时荧光定量PCR分析证实miRNA及其靶基因在冷胁迫下呈负相关关系。

 
图1 菜用大豆miRNA靶基因GO富集分析

本研究为miRNAs参与菜用大豆冷胁迫应答提供了强有力的分子证据，也为菜用大豆冷胁迫响应miRNA的调控作用提供了更深刻的见解。

本研究中的小RNA测序、降解组测序，以及两者的联合分析由联川生物协助完成

参考文献
Xu SC, et al. (2016) Identification of chilling-responsive microRNAs and their targets in vegetable soybean (Glycine max L.). Scientific Reports. DOI: 10.1038/srep26619.

联川生物为研究人员提供从miRNA鉴定到调控靶基因功能分析的一站式解决方案

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