中国水产科学院李健课题组：基于iTRAQ技术鉴定梭子蟹中与生长相关的差异表达蛋白

　　

梭子蟹广泛分布在韩国，日本，中国和东南亚的沿海水域。这种物种栖息在河口和沿海水域。 在中国，它是一种主要的食用蟹种和重要的渔业资源，也是中国重要的养殖物种。目前关于梭子蟹的研究已经很广泛，但关于其遗传背景信息的研究亟待深入。目前为止，关于梭子蟹蛋白质组学的研究比较少。

在这项研究中，中国水产科学院李健课题组利用iTRAQ蛋白质组定量分析技术对梭子蟹中与生长相关的蛋白质组进行了分析与鉴定，以了解其分子机制。从梭子蟹五种组织：眼眶、鳃、心脏、肝胰腺和肌肉中分离总蛋白，利用iTRAQ技术对每个组织中等量蛋白质进行蛋白质组分析。基于液相色谱与串联质谱法和de novo测序数据，总共鉴定了961个蛋白质。以1.2倍的表达变化作为生理学显着的基准，发现了30个与梭子蟹生长相关的差异表达蛋白（DEP），这些蛋白质大部分是表达上调的，包括参与代谢、免疫反应、DNA重复和蛋白质合成等相关的蛋白质，表明能源守恒是应对生长的重要战略。使用iTRAQ的分析结果与测定的mRNA表达水平之间存在高一致性，突显出了蛋白质组学方法的高重现性，以及其在阐明梭子蟹生长调节分子机制中的巨大价值。

 
图 梭子蟹中八个基因的mRNA和蛋白质水平比较

在本研究中，第一次使用iTRAQ方法来研究梭子蟹中生长相关的分子机制。研究确定的30种新型与生长相关的差异表达蛋白，包括GTP-binding核蛋白和几种细胞内相关蛋白。 此外，本研究还鉴定了多种免疫及脱皮相关蛋白，揭示了该物种的生长机制。研究还发现，近交繁殖抑制许多生理活性并降低了细胞间蛋白质浓度。

本研究中的iTRAQ蛋白质组定量分析由联川生物协助完成。

用户文章
Ren XY,et al.(2016)iTRAQ-based identification of differentially expressedproteins related to growth in the swimming crab,Portunustrituberculatus. Aquaculture Research. doi:10.1111/are.13155

联川生物为研究人员提供iTRAQ蛋白质组定量分析技术

获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打咨询热线0571-87662413
 
关于联川生物
联川生物成立于2006年，经过多年的快速发展，已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文22篇。