中国水产科学院沙珍霞课题组：利用转录组测序技术发现和鉴定俄罗斯鲟鱼性腺中性别相关的候选基因

　　

俄罗斯鲟鱼（Acipenser gueldenstaedtii）是一种重要的食物，是味道鲜美的鱼子酱食材的主要来源，因此发现与鉴定其性别分化相关的基因是非常有必要的。然而，俄罗斯鲟鱼复杂的生命和成熟周期对早期准确识别其性别带来了很大的限制。

在这项研究中，中国水产科学研究院及海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室沙珍霞课题组，利用转录组测序技术对不同生长阶段的俄罗斯鲟鱼的性腺进行了研究，并通过实时定量RT-PCR进行验证，鉴定了第一个与性别相关的特定基因。取1，2和5年生俄罗斯鲟鱼的性腺，通过转录组测序，共产生了6,000万个原始读数，过滤后共获得38,505个unigenes。其中参与信号转导机制的基因是最丰富的，表明鲟鱼性腺的发育受信号转导机制的控制。差异表达基因分析表明雌性鲟鱼性腺中蛋白质合成，细胞色素c氧化酶亚基和核糖体蛋白相关基因的表达比雄性中更丰富。而雄性性腺比雌性性腺中表达出更多的转座因子转座酶，逆转录酶和转座酶相关的基因。总共在转录组数据中检测了雌雄间性基因342个，雄性基因782和雌性基因7,845个。研究发现雌性性腺比雄性性腺中表达了更多的基因，表明更多的基因参与了雌性性腺发育。

在不同性别中差异表达的基因（sox9，foxl2），可能是俄罗斯鲟鱼中重要的性别相关基因。Sox9基因与雄性性腺发育相关，foxl2基因与雌性性腺发育相关。

 
图 不同生长阶段鲟鱼性腺差异表达基因Venn图
（2y-T：2年生雄性性腺；2y-O：2年生雌性性腺；5y-T：5年生雄性性腺；5y-O：5年生雌性性腺）

本研究中的转录组测序由联川生物协助完成。

用户文章
ChenYD,et al.（2016）Discovery and identification of candidate sex-related genes based on transcriptome sequencing of Russian sturgeon (Acipenser gueldenstaedtii ) gonads.Physiol Genomics.doi:10.1152/physiolgenomics

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