河南农大汤继华课题组：玉米穗节间发育过程中响应激素信号的miRNA及其靶基因的鉴定

　　

节间长度是影响植物高度（PH）和穗位高度（EH）的决定性因素之一，而这与玉米的抗倒伏性、生物量和谷物产量密切相关。目前研究认为miRNA是重要的转录/转录后调节因子，在植物生长和发育中起着重要作用。然而，它们在调节玉米穗节间发育过程中的作用仍不清楚。

为了确定miRNA及其靶基因在玉米穗节间发育过程中的作用，研究者利用两个节间长度不同的近交系“Xun928”和“Xun9058”的第7、第8和第9个节间构建了6个miRNA和2个降解组文库。测序结果显示，两个品系的玉米在第7、第8和第9个节间的相应比较组（两个品系中相同节间比较）中共有45和54个miRNA显示出明显差异。其中表达差异显著的31个miRNA在两个品系的三个节间相应的比较组中相同。通过将“Xun9058”与'Xun928'的三个节间miRNA的表达进行比较，发现“Xun9058”品系的第7个节间上调和下调的miRNAs数目分别为11和36，第8个节间的分别为9和45，第9个节间的分别为9和25。此外，与“Xun9058”的相应节间相比，包含45个成员的10个miRNA家族至少在“Xun928”的两个节间表现出显著差异。基于测序数据，从 5个保守的miRNA家族中筛选出与激素信号传导相关的20个miRNA，利用qRT-PCR对其进行表达谱分析。降解组测序分析表明，5个保守miRNA家族为zma-miR160，zma-miR167，zma-miR164，zma-miR169和zma-miR393，这些miRNA的靶基因分别为编码生长素响应因子，含N-乙酰半胱氨酸结构域的蛋白，核转录因子Y和生长素信号传导基因F-BOX2。

 
图 RT-PCR测定玉米节间miRNA靶基因表达水平

miRNA可通过调节他们的靶基因来响应激素信号，从而调节玉米节间伸长及穗位发育。本研究结果为理解玉米节间长度可能的调节机制提供了宝贵的参考。

本研究中的降解组测序由联川生物协助完成。

用户文章
Zhao Z， et al. (2016) Genome-Wide Identification of miRNAs and Their Targets Involved in the Developing Internodes under Maize Ears by Responding to Hormone Signaling. PLoS ONE. doi:10.1371/journal. pone.0164026

联川生物为研究人员提供从miRNA鉴定到调控靶基因功能分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打咨询热线0571-87662413
 
关于联川生物
联川生物成立于2006年，经过多年的快速发展，已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文22篇。