中国科学家6月参与发表多篇Nature文章

　　生物通报道：6月中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表，其中主要包括癌症干细胞研究进展，CRISPR-Cas9技术应用，以及水稻研究新进展等。

首先来自浙江大学医学院附属第一医院的研究人员揭示了色氨酸的一种代谢产物ITE抑制肿瘤干细胞增殖的分子机制，ITE将有望开发成为具有全新作用机理和重要临床价值的一类抗癌药物。

ITE是一种人体必需氨基酸———色氨酸的代谢产物之一。研究人员首先通过生物信息学方法，发现Oct4基因的启动子区域有AhR的潜在结合位点，之后他们通过生化实验证实：AhR的确是看管Oct4基因大门的一位“门童”。

随后，研究人员又设计了一系列实验来探究作为AhR配体的ITE是否会影响Oct4的转录。当把脑胶质瘤细胞培养在缺氧环境中，或培养在神经干细胞培养液中形成富含肿瘤干细胞的肿瘤微球（tumor sphere）时，细胞内源ITE含量显著下降，伴随着Oct4表达的显著上升。进一步的动物实验显示，如果把脑胶质瘤、肝癌、前列腺癌等多种肿瘤细胞异位或原位接种至裸鼠形成移植瘤，再进行ITE腹腔注射或瘤内注射给药，肿瘤的增殖受到了明显的抑制，瘤体增长停滞或显著减缓。而对照组中，瘤体迅速增大。

而来自南京大学学模式动物研究所的研究人员与Wellcome Trust Sanger研究所展开合作，调查了Cas9基因改良小鼠的脱靶突变情况。

研究人员报告称利用全基因组测序更全面地评估了注入Cas9与Cas9切口酶诱导的损害。他们首先采用Cas9和Cas9 D10A切口酶诱导出了Ar双等位基因缺失的小鼠(C57BL/6J × CBA)， 然后让两种雌性小鼠与C57BL/6J雄鼠交配，对生成的杂合子Ar突变小鼠后代进行了测序。为了控制品种特异性的变异，他们还测序了一只C57BL/6J小鼠和CBA小鼠。然后以20–25×的深度进行全基因组测序检测了95%以上的杂合变异。具体内容：南京大学黄行许Nature子刊CRISPR-Cas9研究新文章

此外，还有来自北大的一项技术成果也值得关注：北京大学生命科学学院伊成器研究组报道了一种通过化学标记和富集手段实现全转录组水平上假尿嘧啶RNA修饰的单碱基分辨率测序技术CeU-Seq，并绘制了人和小鼠细胞转录组中假尿嘧啶RNA修饰的谱图。

研究人员首先利用高分辨质谱对mRNA中的假尿嘧啶修饰进行定量，发现其广泛存在于各种细胞系及小鼠的组织当中，并且在哺乳动物mRNA中丰度相当高。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段，发展了“CeU-Seq”—一种利用小分子化合物实现特异性标记与富集的假尿嘧啶高通量测序技术。

利用这一技术，该研究成功实现了人细胞系以及小鼠（大脑与肝脏组织）全转录组水平的单碱基分辨率假尿嘧啶检测，发现在数千个mRNA与长非编码RNA（lncRNA）上都含有假尿嘧啶修饰。该研究进一步确定了多个可以作用于mRNA上的假尿嘧啶合成酶（其中PUS1、DKC1两种酶之前被发现与线粒体肌病、先天性角化不良等人类疾病相关），并且发现转录组中假尿嘧啶的含量与分布均会受到各种环境刺激的调控，呈现出“刺激条件特异性”的诱导修饰。

（生物通：万纹）