钱书兵博士Nature Methods发表新测序技术

　　

生物通报道：细胞有一套精妙的机制，根据环境变化调整蛋白质合成的速率。翻译调控大多发生在起始阶段，通过快速改变蛋白的表达水平，帮助细胞灵活应对外界压力。

尽管人们早就意识到翻译起始的重要性，但直接检测单个mRNA的起始率一直比较困难。对起始密码子进行系统性作图，精确检测相应的起始率，无疑将为翻译调控领域带来一场变革。

日前，康奈尔大学的研究团队开发了一种定量分析翻译起始的新测序技术，定量翻译起始测序（QTI-seq）。该技术能够在单核苷酸分辨率上对起始翻译的核糖体进行实时作图。这项研究发表在最近一期的Nature Methods杂志上，文章的通讯作者是康奈尔大学营养系助理教授钱书兵（Shu-Bing Qian）。钱书兵博士早年毕业于上海交通大学医学院。主要研究兴趣包括营养信号通路、应激反应、蛋白质合成、以及它们在人类疾病中的意义。

QTI-seq得到的翻译起始图谱不仅揭示了多样化的起始密码子选择，还展现了在营养匮乏条件下细胞翻译起始的动态变化。这些数据为人们提供了独一无二的视角，有助于深入理解选择性翻译原则和翻译起始的调控机制。（延伸阅读：PNAS惊人发现：核糖体兼具调控功能）

研究人员在RiboTag小鼠中，用QTI-seq实现了组织特异性的起始核糖体分析。肝细胞核糖体图谱显示，在禁食情况下小鼠肝细胞的蛋白酶体系统出现了翻译水平上的显著重编程。这种普遍存在的翻译调控对于机体的生理性适应至关重要。

目前我们对翻译起始机制的理解，主要是在体外培养的细胞中获得的。QTI-seq可以在细胞和组织中全面监控蛋白翻译的起始，首次实现了起始核糖体的织特异性分析。QTI-seq、RNA-seq和Ribo-seq相结合，能为人们展示在差异性生长条件下的核糖体翻译全景图。

QTI-seq是一种能在细胞和组织中定量研究起始核糖体的技术。该技术将帮助我们从整体上理解翻译起始的基础机制。

 

生物通编辑：叶予

生物通推荐原文：

Quantitative profiling of initiating ribosomes in vivo