快速定位DNA改变对基因表达的影响,鉴定潜在的癌症驱动事件

【字体: 时间:2014年12月04日 来源:Affymetrix

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  Affymetrix公司今天宣布推出Concurrent Molecular Analysis Profiling(CoMAP™)功能,这让癌症研究人员能够将全基因组拷贝数数据与基因表达谱相结合,快速了解DNA拷贝数变化的功能影响,从而经济高效地查看和鉴定癌症驱动事件。

  

2014年11月12日,来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息 – Affymetrix公司(纳斯达克代码:AFFX)今天宣布推出Concurrent Molecular Analysis Profiling(CoMAP™)功能,这让癌症研究人员能够将全基因组拷贝数数据与基因表达谱相结合,快速了解DNA拷贝数变化的功能影响,从而经济高效地查看和鉴定癌症驱动事件。

癌症样本的全基因组DNA分析已经表明,拷贝数改变较其他DNA异常而言影响了更多的基因组。这些改变中的许多是癌症的“驱动”事件,而其他只是“次要”事件。破译哪些DNA改变是“驱动”事件,哪些又是“次要”事件,这一直是个挑战。同时关联全基因组基因表达变化与拷贝数改变的能力将有助于快速鉴定并优先研究潜在的驱动事件,这反过来可促进功能性的生物标志物的鉴定。这对于研究“C类”肿瘤的研究人员而言特别有价值,这些肿瘤的特征为功能性拷贝数变化,而不是体细胞获得性突变。

CoMAP是Affymetrix新的Chromosome Analysis Suite(ChAS)3.0软件中包含的新功能,它让研究人员能够轻松快速地分析和查看癌症样本中的拷贝数变化对基因表达的功能影响,包括FFPE组织。这种功能同时结合并关联全基因组拷贝数数据以及Affymetrix分析所产生的mRNA和miRNA数据,这些分析包括OncoScan® FFPE Assay Kit、GeneChip® Human Transcriptome Array 2.0和GeneChip® miRNA 4.0 Array。这种方法让研究人员能在短短三天内从样本中获得所需信息。关联图谱可从所有RefSeq基因产生,也可从定制的基因列表产生。

“尽管每年花在癌症研究上的经费高达数十亿美元,但癌症仍然是全世界最主要的死亡原因之一。Affymetrix致力于通过提供实用而经济的工具来实现转化研究,让研究人员能够快速地将他们的发现转化为不断进步的癌症诊断和治疗方法,”Affymetrix的首席运营官Andy Last博士谈道。

关于ChAS 3.0及CoMAP功能的更多信息,请访问www.affymetrix.com/comap

了解CoMAP功能的详细信息

请注意:Affymetrix、Affymetrix的徽标、CoMAP™、GeneChip® 和OncoScan® 为Affymetrix公司所有。其他所有商标均为其各自所有者所有。

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