测序技术发展太快?千万美元大奖告吹

【字体: 时间:2013年08月27日 来源:生物通

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  据外媒报道,X奖基金会近日决定取消基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize),因为基因组测序成本的直线下降已使得竞争毫无意义。“我们认为竞赛不能激励技术改变,而那正是我们的主席Craig Venter博士、我们的赞助商Stewart and Marilyn Blusson以及X奖委员会的初衷。”

  

据外媒报道,X奖基金会近日决定取消基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize),因为基因组测序成本的直线下降已使得竞争毫无意义。

X奖基金会的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了关闭竞赛的决定。他表示,这是因为如今每个基因组的测序费用不到5,000美元,并能在几天内完成。“我们认为竞赛不能激励技术改变,而那正是我们的主席Craig Venter博士、我们的赞助商Stewart and Marilyn Blusson以及X奖委员会的初衷。”

“基于这一理由,我们决定有史以来第一次取消X奖。”

基因组学X奖于2006年启动,旨在刺激测序创新。目标是在10天内对100个人类基因组进行测序,每个基因组的费用控制在1万美元以下。之后,目标调整为对100个百岁老人进行测序,以便创建出医疗级别的基因组。参赛队伍被要求在30天内完成测序,且每个基因组的测序费用控制在1,000美元或以下。此外,还有准确性和完整性方面的要求。

基因组学Archon X奖的奖金高达1000万美元。

参赛队伍的正式招募从2011年11月开始。去年7月,Life Technologies成为第一支正式报名参赛的队伍。三个月后,哈佛大学Wyss研究所George Church 领导的队伍加入。然而,到今年5月31日报名截止时,也仍然只有这两支队伍。不过,发言人表示,取消竞赛的决定与参赛人数无关。

《Nature》的记者Erika Check Hayden曾表示,要想赢得这1000万美元可没那么简单。目前主流的测序技术是对DNA短片段测序,再进行拼接,会引入错误,难以达到X奖对错误率的要求。而对长片段测序的新技术比较慢,也很昂贵。

Diamandis表示,尽管已取消,但这次竞赛让人们看到了快速、低成本的医疗级别基因组的需求。此外,它也带来了一些重要的资产。100位百岁老人的血液样本被采集,且细胞系已建立,以保存他们的DNA。

同时,在邓普顿基金会(Templeton Foundation)的支持下,验证步骤已建立。Diamandis认为这是行业第一个分析工具,可评估全基因组序列的整体质量。“两者都有巨大的潜力,将使全世界的基因组学研究界受益。”

与此同时,基因组学X奖的高级主管Grant Campany不排除有另一个X奖,也是关于基因组学方面的竞赛。“我们正在与冠名赞助商讨论其他可能的奖项赞助机会。”(生物通 余亮)

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