分子系统发生学协助确定罪犯

　　

生物通报道 一个西班牙研究小组利用分子系统发生学，将丙型肝炎病毒的爆发归咎于一名麻醉师，从而协助了他的定罪。这个像电影一样的故事真的发生在西班牙，而且还发表在BMC Biology上。

1998年2月，一系列丙型肝炎病毒（HCV）病例引起了人们的注意，这些患者都曾在瓦伦西亚一间私立医院进行过小手术。公共卫生官员开展了流行病学调查，认为这些感染的源头可能是一名麻醉师，他还曾在一家公立医院工作。经过大量调查，人们发现几乎所有的患者都曾在这两家医院接受过治疗。

公共卫生部门和法官希望借助进化生物学的知识，了解(1)怀疑的源头是否真正引起了这次爆发；(2)确定哪些患者是从同一源头感染，而哪些患者是从其他源头感染；(3)抛弃同时爆发的其他源头；(4)确定爆发的持续时间；(5)每位患者的感染时间，以及(6)确定源头的感染时间。

于是，瓦伦西亚大学的Fernando González-Candelas及其同事对322名丙肝患者和44名本地对照的NS5B和E1-E2病毒区域进行了测序。随后他们将那些区域与假定源头进行了比较。47名患者被排除，因为感染来自本地，而非这名麻醉师。

此外，由于少数患者的感染日期已知，研究人员可开发出分子钟，从而估计其他患者的感染时间。同时，他们采用类似分析来估计源头的感染时间。他们认为，麻醉师的感染是在爆发前十年。

研究人员写道：“我们利用HCV的快速进化来理清一个庞大而复杂的传播过程，从单一源头到近300名患者，在这一时期病毒本身经历了进化上的改变。另外两个问题让这一过程更加复杂：大量可能受影响的患者，其中一些可能被其他未知源头的HCV感染；以及需要提供个体而非群体的陈述，在法庭上说明感染是否来自假定的源头。”

最终，在研究结果的协助下，法院认定这名麻醉师将丙肝病毒传染给275人，并判处1933年监禁。

牛津大学的Oliver Pybus对此事发表评论，认为西班牙研究人员的工作是用来支持其他的证据，而并非指控有罪。他认为，病毒系统发生的估计和解释本身具有不确定性，因此它们在法庭上的使用要有别于DNA指纹图谱。（生物通 薄荷）

原文检索

Molecular evolution in court: analysis of a large hepatitis C virus outbreak from an evolving source

BMC Biology 2013, 11:76 doi:10.1186/1741-7007-11-76