J Gen Virol:草地贪夜蛾miRNA组研究

【字体: 时间:2013年03月06日 来源:联川生物

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  澳大利亚昆士兰大学的研究人员,使用深度测序(联川生物公司提供测序技术服务),生物信息学分析以及实验手段,成功鉴定出草地贪夜蛾细胞(Spodoptera frugiperda cells ,Sf9)miRNA中保守和新的miRNA*。该研究成果发表在近期的J Gen Virol上。

  

microRNA(miRNA)作为非编码小RNA在众多生物进程包括发育,细胞信号传导以及免疫反应中发挥着重要作用。研究也表明miRNA在宿主-病毒互作中发挥着重要作用,宿主通过差异表达miRNA靶向调控病毒的关键基因来限制病毒感染。澳大利亚昆士兰大学的研究人员,使用深度测序(联川生物公司提供测序技术服务),生物信息学分析以及实验手段,成功鉴定出草地贪夜蛾细胞(Spodoptera frugiperda cells ,Sf9)miRNA中保守和新的miRNA*。该研究成果发表在近期的J Gen Virol上。

研究者发现,S. frugiperda的miRNA也具有其他生物体miRNA的共同特征,比如miRNA的5’末端是U。miRNA的5’末端比3’末端更为保守,揭示进化上保护miRNA的种子序列,占主导的miRNA在节肢动物中是保守的。同时也鉴定出大多数与家蚕中同源的miRNA(76/90)。他们发现S. frugiperda的miRNA存在种子序列移位和臂交换现象。在感染杆状病毒后大部分的miRNA表达水平发生变化,大部分出现下调。这表明感染杆状病毒主要引起细胞内miRNA的表达抑制。同时还发现有4个基因在转录后水平被sfr-miR-184调控。

本研究的结果进一步支持昆虫miRNA和其他生物miRNA具有保守性。同时也显示在感染杆状病毒后宿主miRNA表达发生变化,暗示miRNA在宿主-病毒互作中的作用。

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*Mehrabadi M, Hussain M, Asgari S. (2013) MicroRNAome of Spodoptera frugiperda cells (Sf9) and its alteration following baculovirus infection. J Gen Virol [Epub ahead of print]. [Abstract]

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