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Illumina推出癌症分析服务
【字体: 大 中 小 】 时间:2012年03月14日 来源:生物通
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生物通报道 Illumina公司近日宣布通过Illumina基因组网络(Illumina Genome Network,IGN)推出癌症分析服务,它将凭借Illumina技术的高准确性为癌症研究人员提供可轻松阐释的肿瘤/正常测序数据,以便快速推进他们的研究。
生物通报道 Illumina公司近日宣布通过Illumina基因组网络(Illumina Genome Network,IGN)推出癌症分析服务,它将凭借Illumina技术的高准确性为癌症研究人员提供可轻松阐释的肿瘤/正常测序数据,以便快速推进他们的研究。
Illumina的Genome Network将有兴趣开展大型人类全基因组测序项目的研究人员与全世界领先的研究所联系起来,这些经过CSPro认证的机构利用Illumina测序平台提供经济且快速的服务。每个IGN伙伴都拥有十台以上的Illumina测序仪(HiSeq系统和/或Genome Analyzer),在生成高质量、经济的人类基因组数据方面有着丰富的经验,能让研究人员快速且自信地完成基因组测序项目。
IGN伙伴目前包括:加拿大BC癌症中心的基因组科学中心、华盛顿大学基因组科学系、美国国家基因组资源中心(NCGR)、Macrogen/基因组医学研究所,以及Illumina自己的FastTrack Services。上个月,Broad研究院也加入了Illumina的Genome Network。它将提供专利的样品制备处理,对富有挑战性的少量DNA和FFPE样品进行测序。
只需要少量样品(5 μg),Genome Network就能带来准确、可轻松阐释的全基因组测序数据。癌症在遗传和组织学水平具有明显的异质性。因此,所采用的变异体检出方法需要正确地对多个癌症亚克隆的复杂度建模。Genome Network经过优化的检出方法产生了准确的体细胞突变检出,可获得97%的已知SNV,即使肿瘤纯度很低(<40%)。
Illumina的副总裁Scott Kahn表示:“研究人员大可信赖IGN数据的质量,并自信地开展下一步研究。高的数据质量,以及我们整合转录组或甲基化组研究数据的独特能力,将让研究人员更深入地了解癌症机理。”
除了癌症分析服务,Illumina还与领先的数据分析和可视化公司合作,包括Diagnomics、Ingenuity和Knome,提供优化的软件工具,协助下游IGN数据集的过滤和拷问,其目标是获得生物学相关且可行动的结果。数据可与后续测序、基因分型和RNA-Seq研究的结果整合,帮助研究人员更好地理解癌症以及它所影响的生物学通路。
去年,Illumina下调了个人基因组测序的价格。对于10个样本或更多的项目,每个基因组的价格为5000美元,对于50个样本或更多的大项目,价格则低至4000美元。(生物通 余亮)