哈医大新文章：揭示miRNA调控机制

　　

生物通报道 近日，哈尔滨医科大学的研究人员在生物信息学领域的世界顶级杂志《生物信息学简讯》（Briefings in Bioinformatics）上发表了题为“解析人类miRNA(微小核苷酸)对子通路的调控影响”的科研论文，SCI影响因子高达9.283。

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领导这一研究的是哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院院长、国家高技术研究发展计划(863计划)课题组负责人李霞教授。其多年来一直从事生物信息学领域的教学和科研工作，作为学术带头人，创建了哈医大生物信息学学科，先后承担科研课题30余项，在国内外重要学术刊物和学术会议上发表学术论文120余篇。近年来，李霞教授致力于复杂疾病功能基因识别方法的研究在复杂疾病基因作图的模式识别方法研究领域做出重要贡献，论文“Gene mining: a novel …”曾受到了Nobel奖得主Rich Roberts博士的好评。

miRNA是一类单链的非编码RNA分子，在转录后水平调控基因的表达。miRNA参与许多重要的生物学过程，如发育、分化、增殖等，同时，越来越多的研究报道miRNA与多种人类复杂疾病密切相关，如癌症、糖尿病、心血管疾病等。

在先前的研究中李霞课题组发现：某些疾病的发生并不是整个生物学通路异常所导致的，而更可能是通路的某个局部区域(子通路)发生了功能失调。此次，李霞教授带领课题组首次在系统水平识别出了480个人类miRNA所调控的子通路，筛选出了miRNA协同调控的功能相关的子通路簇，并深入研究了癌症等123种疾病相关的miRNA对子通路的调控特点。结果提示从协同的角度研究人类microRNA对子通路调控的影响不仅是系统解释microRNA调控机理的一个重要突破点，而且对于研究microRNA在疾病发生、发展过程中发挥作用的机制具有重要意义。

该研究是研究人员首次从全局性的角度建立miRNA对子通路的调控关系，并对miRNA(尤其是疾病miRNA)的调控特点进行了深入分析。该成果不但有助于解析miRNA的调控机制，而且对于准确定位疾病基因具有重要的参考和帮助。

此外，为了将计算分析的成果应用到生物学实验或临床研究中，李霞教授的课题组还开发了方便、快捷的网络分析平台(http://bioinfo.hrbmu.edu.cn/miR2Subpath)。生物医学家只要选择感兴趣的miRNA，平台就会提供包括该miRNA关联的疾病、靶基因、子通路以及靶基因在子通路中的位置等信息，这些结果以可视化的通路形式给出，从而更直观地指导进一步实验的开展。

（生物通：何嫱）

作者简介：

李霞

“龙江学者”特聘教授、北京“百千万人才工程”入选者、博士、博士生导师、哈医大生物信息科学与技术学院院长，黑龙江省优秀中青年专家。1993年任副教授，1997年破格晋升为教授，1999年12月到2001年1月受美国UNC与CWRU复杂疾病基因定位奠基人Robert Elston博士邀请，作为访问教授赴美从事复杂疾病基因定位连锁作图和基因表达谱疾病基因发现等研究工作。
 
主要研究方向:

基于生物谱的复杂重大疾病的分子分型与生物标志物识别；生物信息融合分析技术；分子生物网络（SNPs虚拟网络、基因调控网络、miRNA-mRNA协同调控网、蛋白质互作网络等）重建；miRNA与复杂疾病调控机制研究；复杂疾病的风险通路（pathway）识别技术；基因与蛋白质功能研究的生物芯片信息学分析技术；高通量药物分子靶标筛选技术；研发解析癌症分子机制的生物信息学方法与分析平台等。

李霞教授多年来一直从事生物信息学领域研究，先后承担课题30余项，其中，国家863高科技计划项目3项（组长1项、副组长1项、参加1项），国家973前期项目1项（主持），国家自然科学基金项6项（主持 5项），获省部级奖4项，厅局级奖8项，在国内外重要学术刊物和学术会议上发表论文120余篇(其中SCI 59篇、EI 18篇)，累计SCI影响因子161，总引次数116。尤其在癌症等重大疾病功能基因识别方法的研究取得重要研究成果，科学研究论文发表在国外著名生命科学杂志《Nucleic Acids Research》(5篇，SCI影响因子：7.479)，《Briefings in Bioinformatics》（SCI影响因子：7.329），《Bioinformatics》(SCI影响因子：5.42)，《BMC Bioinformatics》(SCI影响因子：4.82)，《中国科学》，《American Journal of Human Genetics》 （SCI杂志影响因子11），《Journal of Medical Genetics》（杂志影响因子7.7），《Progress in Natural Science》等上，并获得省政府自然科学2等奖项，在复杂疾病基因作图的模式识别方法研究领域做出重要贡献，其中论文“Gene mining: a novel and powerful ensemble decision approach to hunting for disease genes using microarray expression profiling.”受到了Nobel奖得主Rich Roberts博士的好评，并迅速成为英国牛津出版集团旗舰科学杂志《Nucleic Acids Research》的热点文章(Hot Papers)。