华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目

【字体: 时间:2011年03月23日 来源:华大基因

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  世界最大规模的基因组学研究中心——华大基因宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目(Earth Microbiome Project,EMP),并承担核心工作。该项目旨在全方位、系统性地研究全球范围内的微生物群落的功能及进化多样性,以便更好地造福社会及人类。

  

2011年3月22日,世界最大规模的基因组学研究中心——华大基因宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目(Earth Microbiome Project,EMP),并承担核心工作。该项目旨在全方位、系统性地研究全球范围内的微生物群落的功能及进化多样性,以便更好地造福社会及人类。

与以往的微生物研究有所不同,该项目的研究对象不仅仅集中于海洋和人体环境中微生物群落,还包括土壤、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。该项目将对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或者宏基因组测序从而建立一个全球性的基因图谱。华大基因将会负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定,并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。这些信息学分析流程将为EMP产生的海量数据提供一个分析框架。

EMP的项目负责人、芝加哥大学和阿贡国家实验室的教授Jack A. Gilbert博士说:“华大基因在测序能力、测序技术发展和信息分析等方面已展现出卓越的能力,EMP是一个前所未有的最大的基因组测序项目,作为全球最大基因组学研究中心的华大基因的参与是至关重要的,另外,华大基因对科学追求卓越的态度使其成为参与EMP的理想选择。”

华大基因理事长杨焕明院士表示:“我们(华大基因)非常荣幸能够作为主要参与者参加如此重要的研究项目。微生物对地球上所有的生命具有至关重要的作用而我们对微生物的复杂性和多样性认识不足,征服这个未知的领域是非常有必要的。华大基因拥有国际先进水平的测序平台和强大的生物信息学分析能力,我们相信我们可以为促进人类对微生物群落的重要性的了解贡献出价值和力量。”

2011年6月13日至15日,华大基因将联合EMP 联盟(Earth Microbiome Project Consortium)在深圳共同举办第一届EMP大会。作为本次大会的主办方,华大基因将与来自各地的学者们分享微生物学、微生物基因组学及相关生态、健康、医学、工业、农业等各领域最新的学术成果及应用前景。更多会议相关信息,请登陆www.ldl.genomics.cn/page/event.jsp

关于华大基因 www.genomics. cn
华大基因自1999年成立以来,坚持“以任务带学科、带产业、带人才”,先后完成了国际人类基因组计划“中国部分”(1%)、国际人类单体型图计划(10%)、水稻基因组计划、家蚕基因组计划、家鸡基因组计划、抗SARS研究、炎黄一号、大熊猫等多项具有国际先进水平的基因组科研工作,在Nature和Science等国际一流的杂志上发表多篇论文,奠定了中国基因组科学在国际上的领先地位;同时建立了大规模测序、生物信息、克隆、健康、农业基因组等技术平台,其测序能力及基因组分析能力世界领先。
目前,华大基因已形成了科学、技术、产业相互促进的发展模式,建设了一支具有世界一流水平、年轻的产学研队伍,致力于开展知识产权密集型的人类健康、规模化重要物种、重要经济动植物等基因组研究,大力发展我国的医学健康产业和现代农业产业。
在未来十年的发展中,华大基因将依靠以高通量测序为代表的生物技术和以高性能计算为主体的信息技术紧密结合的技术平台,继续向基因组科学的顶峰迈进;同时孵化医药健康、现代农业及新生物能源等一批有良好市场前景的产业项目,最大化地运用基因组技术服务社会、创造效益,为中国生物经济的腾飞做好前瞻性、原创性和战略性的工作。

关于Earth Microbiome Project(EMP)www.earthmicrobiome.org
微生物生态学的一个重要挑战在于如何从微生物的结构与功能上来了解微生物(细菌、古细菌、真菌和病毒)。全球微生物基因组研究项目(EMP)提供了相应的解决方案,包括问题本身以及潜在的问题。在任一时间,大约有1 x 1030个微生物生活在这个地球上(地球上的微生物要比其他已知星球上的多)。但是,到目前为止,全球环境DNA总量却比一升海水或一克泥土里所提取的DNA量的百分之一还要少。因此,极度缺少对地球上复杂多样的微生物研究。然而,高通量测序技术为探索微生物世界提供可前所未有的机会。与以前的微生物或微生物群体测序相比,EMP的提出将会带来更加巨大的影响。该项目可以获得大约500,000个重测的基因组,一个全球的代谢模型和一个所有信息可视化的数据分析入口,这将可以更好的描述每个生物群落的蛋白质空间结构及环境代谢模型。参与该项目的主要单位有华大基因(BGI)、阿拉贡国立实验室、芝加哥大学、科罗拉多大学、劳伦斯•伯克利国立实验室和美国基因能源联合研究所。

更多项目信息,请联系:
阿贡国家实验室
Jack A Gilbert教授  +1-630-252-7489 
gilbertjack@ANL.gov
美洲华大
Joyce Peng博士   +1-626-222-5584 
joyce.peng@bgiamericas.com  www.bgisequence.com (www.bgiamericas.com)
华大基因
杨碧澄博士  +86-755-25273450 
yangbicheng@genomics.cn  www.genomics.cn

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