学习文献看什么？最新推荐七大生物化学论文

　　

生物通报道：“F1000（Faculty of 1000 Medicine）”又名“千名医学家”，是由美国哈佛大学和英国剑桥大学等全世界2500名国际顶级医学教授组成的国际权威机构。其中近期最受关注的七篇生物化学论文如下：

A. Ben-Shem et al., "Crystal structure of the eukaryotic ribosome," Science, 330:1203-09, 2010. Evaluated by Daniel Gallie, UC Riverside; Margaret Elvekrog, Daniel MacDougall and Ruben Gonzalez, Columbia Univ; Robert Batey, Univ. of Colorado at Boulder; Dmitri Ermolenko and George Makhatadze, Rensselaer Polytechnic Institute.

研究人员利用X射线晶体学技术以4.15埃的分辨率获得酵母80S核糖体晶体结构模型，这是目前基于X射线晶体学数据获得的第一个真核生物核糖体模型，以此揭示了核糖体内和核糖体两亚基之间独特的相互作用以及真核生物翻译机制的复杂性，并有助于科学家们更深入地了解真核生物蛋白质合成。这一论文标志着蛋白质合成研究的一个新里程碑。

J.S. Fraser, et al., "Hidden alternative structures of proline isomerase essential for catalysis," Nature, 462:669-73, 2009. Evaluated by Victoria Ann Higman and Linda Ball, Leibniz-Institut f?r Molekulare Pharmakologie; Andrew Beenken and Moosa Mohammadi, NYU Med Cen; David Cowburn, Coll Medicine Yeshiva Univ; Gira Bhabha and H Jane Dyson, Scripps Res Inst; Fred Dyda, NIH.

霍华德休斯医学研究所的研究人员在原子水平上对一种重要的酶——人亲环素A(human cyclophilin A)的内部结构进行研究，该酶可被HIV病毒用来实现自我复制。

这项研究首次结合了X-射线晶体学(x-ray crystallography)和核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR)技术，获得了该酶在具有催化效力的高能状态下蛋白质的内部结构图像。同时也揭示了这种结构如何影响该酶的催化效力。

在该报告中，研究人员还揭示了人亲环素A从少见的高能状态向常见的低能状态的相互转换(interconversion)过程。如果这种转换很快，那么酶的催化效率越高；反之亦然。

据研究人员Kern介绍，之前人们一直都认为通过催化底物可以加速化学反应的进程，但这项研究表明，蛋白质催化剂本身的活力也非常重要。

P.J. Stephens, et al., "Massive genomic rearrangement acquired in a single catastrophic event during cancer development," Cell, 144:27-40, 2011. Evaluated by Jordi Camps and Thomas Ried, NCI; Yamini Dalal, NCI; Giovanni Neri, Univ Cattolica S Cuore; Robert Booth, Virobay Inc; Yan Xu and Makoto Komiyama, Univ Tokyo.E. Nicodeme, et al., "Suppression of inflammation by a synthetic histone mimic," Nature, 468:1119-23, 2010. Evaluated by Lionel Ivashkiv, Hosp for Special Surgery; Marc Rothenberg, Cincinnati Children's Hosp Med Cen; Xiaodong Cheng, Emory Univ School of Med.

英国科学家找到了“急性癌症”的形成原因：细胞内的染色体发生“爆炸”破坏了DNA，从而让人有可能在短时间内患上癌症。

传统理论认为癌症是人体经历成千上万次的细胞突变后，慢慢演化的结果。但英国著名的疾病研究机构桑格研究所的新发现推翻了这种看法。这暗示了不管人们怎么努力保持身体健康，也不能保证命运不会拿他们开玩笑。同时还说明了为什么有些人在体检时根本没发现癌症痕迹，但数月后突然就被诊断患上这种疾病了。

桑格学院的科学家是通过研究750个肿瘤的遗传缺陷后得出以上结论的。其中大部分的案例都与传统理论相符，染色体的损坏是常年累积的结果。然而，其中至少有1/40的肿瘤不符合“标准模式”，有的染色体似乎是在一夜之间遭到破坏的。

J. Rittle and M.T. Green, "Cytochrome P450 compound I: capture, characterization, and C-H bond activation kinetics," Science, 330:933-37, 2010. Evaluated by Elizabeth Gillam, Univ Queensland; Ivo Feussner, Georg August Univ. G?ttingen, Germany; Russ Hille, UC Riverside; Kap-Sun Yeung and Nicholas Meanwell, Bristol Myers Squibb.

细胞色素P450复合物I：捕获、鉴定和C-H键激活动力学

L.K. Lee, et al., "The structure of the peripheral stalk of Thermus thermophilus H+-ATPase/synthase," Nat Struct Mol Biol, 17:373-78, 2010. Evaluated by Ingo Grotjohann and Petra Fromme, Arizona State University; E Neil G Marsh, University of Michigan; Thomas Meier, Max Planck Institute of Biophysics; Michael Galperin, NIH; Stephan Wilkens, SUNY Upstate Medical University.

M.M. Reddy, et al., "Identification of candidate IgG biomarkers for Alzheimer's disease via combinatorial library screening," Cell, 144:132-42, 2011. Evaluated by Soumitra Ghosh and Kavita Shah, Purdue Univ; Ivan Gerling, Univ Tennessee Health Sci Cen; David Holtzman, Wash Univ School of Med.

美国科学家可能已发现1种新方法，利用血液检测搜寻阿兹海默症（Alzheimer's disease）的线索；这项发现若被证实可行，可扩大应用至其他疾病。

斯克里普斯研究机构（Scripps ResearchInstitute）的柯达戴克（Thomas Kodadek）说：“若这方法对阿兹海默症管用，就显示这是相当普遍性的平台，可能对许多不同疾病也管用。”柯达戴克指出，“现在我们需要把这方法交由疾病专家，应付早期诊断发现是治疗关键的疾病。”

阿兹海默症是最常见的痴呆症，目前无法可治，美国有500万人为这种疾病所苦，所以有不少民众可能认为这种疾病的检测方法并没有太大用途。

不过制药业者可能会利用这项信息，更精确找出接受临床试验的病患。柯达戴克尝试1种鉴定血中疾病信号的新方法，利用名为peptoids的分子，侦测动物和罹患特定疾病患者血流中的抗体。

他从身体状况类似多发性硬化症（multiplesclerosis）的老鼠身上，分离出比健康老鼠更多的免疫球蛋白（Immunoglobulin，1种主要抗体类型）后，他将对象转到人类身上，检测6位阿兹海默症患者、6位巴金森氏症（Parkinson's disease）病患，以及6位健康人士。

这些检测发现，3种分子在阿兹海默症患者身上捕捉的免疫球蛋白数量，是巴金森氏症或控制组的健康人士的3倍。

 “Faculty of 1000 Biology”创办于2002年1月，是一种在线科研评价系统，其推荐原则立足于论文本身的科学意义而非发表在什么杂志上。该系统根据全球2300多名资深科学家的意见，提供对近期发表的生物科学论文的快速评论，目的是帮助广大科研人员遴选和发现有价值的研究工作。该机构专家根据论文对当前世界生物医学和临床实践的贡献程度和科学价值，每年对全球SCI文章总数不足千分之二的优秀精品医学论文进行推荐和点评，并赋予“F1000论文”称号向医学界推荐，涵盖了医学各个学科，是一项很高的学术荣誉。

（生物通：万纹）