同一研究团队顶级杂志公布大规模测序成果

　　

生物通报道：来自帝国理工学院的由多人组成的一支研究团队几年前就开始利用基因测序技术进行大规模功能基因筛选，他们曾在09年进行了上万人的基因组测序分析，从中发现了控制人体血红蛋白含量的基因，为治疗贫血症等病提出了新方法。近期这一研究组又接连参与了几项大规模测序研究，获得了重要成果，其中包括与血压有关的基因，以及与肝功能相关的基因等，相关成果公布在Nature，Nature Genetics等杂志上。

在第一篇文章中，研究人员对61,000多人的基因进行了比对分析，发现了42个与肝脏功能相关的基因序列，其中32个与肝脏的相关性未被报道过，而且研究人员还在这些序列区域中找到了69个与肝功能有关的基因。这将有助于科学家们更加深入地理解肝脏功能异常的机制。从根本上来说，为新的治疗方案指明了方向，并有助于减少肝脏损害及改善肝功能。

肝脏是人体最大的内脏器官，肝脏承担着数百种功能，包括产生蛋白质与凝血因子，以及促进消化与能量释放等。

在这篇文章中，研究人员通过分析样品中肝酶的浓度，对其肝功能进行了评估。肝脏损伤者体内的酶浓度较高，这与如肝硬化、2型糖尿病及心血管疾病的风险增高相关。这项研究也发现与机体其它功能，比如炎症与免疫，以及葡萄糖和其它糖类物质的代谢的基因。

研究人员认为这项研究提供了有关基因如何调控肝脏的新知识。下一步他们将对那些迄今还了解其作用的基因展开。

另外研究人员还通过约20万名欧洲个体的多阶段GWAS meta分析和基因分型研究，追踪了28个影响收缩压和/或舒张压的风险位点。随后，基于这28个位点上的29个独立变异，他们对近2.33万名妇女进行了血压风险评分，发现了与高血压、心脏病和中风的关联。

之后他们又在数万名非欧洲人上开展了后续研究，发现9个位点与东亚群体的血压有关，而6个与南亚人显著相关，这由29个位点数据组成的加权风险评分为了解高血压风险打开了一扇窗。

（生物通：万纹）

原文摘要：

Genome-wide association and large-scale follow up identifies 16 new loci influencing lung function.

Pulmonary function measures reflect respiratory health and are used in the diagnosis of chronic obstructive pulmonary disease. We tested genome-wide association with forced expiratory volume in 1 second and the ratio of forced expiratory volume in 1 second to forced vital capacity in 48,201 individuals of European ancestry with follow up of the top associations in up to an additional 46,411 individuals. We identified new regions showing association (combined P < 5 × 10−8) with pulmonary function in or near MFAP2, TGFB2, HDAC4, RARB, MECOM (also known as EVI1), SPATA9, ARMC2, NCR3, ZKSCAN3, CDC123, C10orf11, LRP1, CCDC38, MMP15, CFDP1 and KCNE2. Identification of these 16 new loci may provide insight into the molecular mechanisms regulating pulmonary function and into molecular targets for future therapy to alleviate reduced lung function.

Genome-wide association study identifies loci influencing concentrations of liver enzymes in plasma

Concentrations of liver enzymes in plasma are widely used as indicators of liver disease. We carried out a genome-wide association study in 61,089 individuals, identifying 42 loci associated with concentrations of liver enzymes in plasma, of which 32 are new associations (P = 10 8 to P = 10 190). We used functional genomic approaches including metabonomic profiling and gene expression analyses to identify probable candidate genes at these regions. We identified 69 candidate genes, including genes involved in biliary transport (ATP8B1 and ABCB11), glucose, carbohydrate and lipid metabolism (FADS1, FADS2, GCKR, JMJD1C, HNF1A, MLXIPL, PNPLA3, PPP1R3B, SLC2A2 and TRIB1), glycoprotein biosynthesis and cell surface glycobiology (ABO, ASGR1, FUT2, GPLD1 and ST3GAL4), inflammation and immunity (CD276, CDH6, GCKR, HNF1A, HPR, ITGA1, RORA and STAT4) and glutathione metabolism (GSTT1, GSTT2 and GGT), as well as several genes of uncertain or unknown function (including ABHD12, EFHD1, EFNA1, EPHA2, MICAL3 and ZNF827). Our results provide new insight into genetic mechanisms and pathways influencing markers of liver function.