Sanger microRNA数据库(miRBase)升级至16.0版[新品推荐]

【字体: 时间:2010年09月19日 来源:联川生物

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  2010年9月10日,Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至16.0版。在新版本中,发夹前体序列升至15172条,新增1068条;成熟miR和miR*产物共17341条,新增1788条;新版本报道序列共涵盖142个物种。

2010年9月10日,Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至16.0版。在新版本中,发夹前体序列升至15172条,新增1068条;成熟miR和miR*产物共17341条,新增1788条;新版本报道序列共涵盖142个物种。

新增microRNA序列动物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增108条,Mus musculus [小鼠]新增82条,Rattus norvegicus [大鼠]新增82条,Sus scrofa [猪]新增36条。植物物种中增长最为显著的是Glycine max [大豆] 和Citrus sinensis [橙],分别增加118条和50条。

此外,新版本中首次收录的物种共有9个,包括:

  • 2个动物物种:Nasonia giraulti [胡蜂] (32),Nasonia longicornis [金小蜂] (28)
  • 6个植物物种:Picea abies [挪威云杉] (40),Arabidopsis lyrata [琴叶拟南芥] (201),Aegilops taushii [粗山羊草] (2),Festuca arundinacea [高羊茅] (15),Hordeum vulgare [大麦] (13),Triticum turgidum [圆锥小麦] (1)
  • Ectocarpus siliculosus [长囊水云] (26)

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关于miRBase
miRBase序列数据库是一个提供包括miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息,详情请访问
http://www.mirbase.org/

关于LC Sciences与联川生物
LC Sciences(美国)是一家专业提供基因组及蛋白质组产品与服务的生物技术公司,提供全方位的DNA,RNA及多肽微阵列服务,可用于核酸/蛋白表达谱与功能分析,生物标记发现和新药筛选,研发应用于诊断和生物传感的微型实验设备。基于专利的µParaflo®微流体技术,LC Sciences可提供具有高度灵活性和定制化的创新产品来满足客户快速变化的需求。联川生物作为LC Sciences在中国成立的全资子公司,随时为您提供最新的生物技术服务和前沿信息。

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