不列颠哥伦比亚省癌症机构再度安装8台SOLiD用于癌症基因组项目

　　

位于加拿大温哥华市的不列颠哥伦比亚省癌症机构（British Columbia Cancer Agency）的基因组科学中心再度安装了8台Applied Biosystems SOLiD 3 plus 仪器，在原来的两台SOLiD 3 plus 和8台3730 Sanger测序仪基础上。

根据Life Technologies发言人的说法，该中心总共购买了10台SOLiD系统，包括在去年夏天收到用于评估的、已经安装好的两台。

基因组科学中心的Marco Marra上周告诉《In Sequence》，该中心初步计划将10台SOLiD系统主要用于乳腺和卵巢肿瘤的全基因组癌症测序。

去年，Marra及同事Sam Aparicio和David Huntsman发表了两篇关于乳腺癌和卵巢癌基因组测序的文章(IS 6/16/2009 和 10/13/2009)，Marra说，“我们将在早前研究的相互作用的基础上继续研究。”

具体来说，科学家们计划在下一年对大约100个肿瘤样品以及配对的正常DNA进行测序，其中乳腺和卵巢癌将成为肿瘤类型的“主要候选”。Life Technologies负责全球SOLiD销售的主管Jay Therrien表示，作为仪器交易的一部分，Life Technologies将提供技术和生物信息学上的支持，以确保项目如期进行。

基因组科学中心也是Illumina多年的老客户，早在2006年底就收到了第一批商业化的Solexa测序仪中的一台，而Solexa在2007年初被Illumina收购。去年夏天，该中心安装了两台SOLiD系统，并获得初步的操作经验。

Marra表示：“我们一直很满意仪器的性能，特别是最近，我们领悟到了在我们庞大的全基因组测序计划中SOLiD系统所能扮演的明确作用。”

他表示，在最近的试验中，研究人员“用SOLiD平台获得了非常好的SNP检出，当然，[运行]费用也很有竞争力。我们认为，它集合了所有适当的因素，可帮助我们实现测序癌症基因组的理想。”

此外，他还表示，他和他的同事对Life Technologies随仪器所提供的服务和支持 “印象极为深刻”， “在我们增加SOLiD平台的决策上，性能和服务起了重要作用。”

根据Therrien表示，SOLiD技术“在过去的六个月明显成熟”，这指的是数据准确性和测序费用降低两方面。他表示，Life Tech最近所引述的关于在SOLiD 4和4hq平台上进行人类基因组测序的试剂费用降至10000美元以下“是有根据的。”他还补充说，“我们在合同上做出承诺。”

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在过去的几个月，他表示，“我们最大的细分市场可能是癌症研究中心，”更多研究中心将开始采用SOLiD平台。（ABI供稿，生物通翻译）