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贝克曼即将推出文库制备系统,简化新一代测序
【字体: 大 中 小 】 时间:2010年01月12日 来源:生物通
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随着新一代测序技术的应用日趋广泛,与之相关的上下游技术也在紧锣密鼓地开发之中。这不,贝克曼库尔特公司就即将推出适合Illumina Genome Analyzer测序仪的文库制备系统。
随着新一代测序技术的应用日趋广泛,与之相关的上下游技术也在紧锣密鼓地开发之中。这不,贝克曼库尔特公司就即将推出适合Illumina Genome Analyzer测序仪的文库制备系统。
此系统名为SPRIworks Fragment Library System I,它利用固相可逆固定化磁珠技术来进行自动化的文库制备。由于排除了柱纯化和凝胶电泳步骤,此文库构建流程很容易自动化。它能够在5小时内制备最多10个DNA文库,且重复性高。
目前该系统正处在测试阶段。根据最新消息,J. Craig Venter研究所将成为第一个吃螃蟹的人。该研究所已经同意了SPRIworks Fragment Library System I的试用。
JCVI的项目经理Holly Baden-Tillson表示:“我们很高兴成为第一个测试SPRIworks Fragment Library System I。在此之前,科学家需要花费一个工作日来制备四个文库,这个过程非常耗时,限制了通量和周转时间,增加了测序费用。通过SPRIworks的运行,我们能够在一个工作日内制备最多20个文库,且文库大小非常一致。”
贝克曼库尔特公司的研发主管Patrick J. Finn博士认为:“SPRIworks系统是专为新一代测序流程的简化和自动化而设计。它将让用户制备更多的测序样品,提高操作效率,并将测序能力最大化。我们很高兴在系统测试阶段与JCVI合作,所产生的性能数据代表了SPRIworks平台开发中的一个重大里程碑。我们期待在未来的SPRIworks应用中延伸这种合作。”
SPRI(固相可逆固定)技术是贝克曼库尔特的专利。其原理是在一定盐(如NaCl、MgCl2、CaCl2、KCl、LiCl等)和聚乙二醇(PEG-8000)的浓度条件下,DNA可非特异性地结合于表面有COOH末端的磁珠上。一旦结合,可用70%的乙醇对DNA-磁珠复合物进行彻底清洗,最后用Tris缓冲液将DNA 洗脱下来。以PEG作为杂交液是因为PEG与蛋白有极好的相容性,并能通过空间位置排斥效应将DNA 聚集于包覆有高分子的磁珠上,这样便可除去样品裂解液中的大量蛋白质。另外,PEG还能增加反应混合物的粘度,使磁珠保持悬浮状态而不沉降。
SPRIworks Fragment Library System I预计将在今年第一季度推出,目前还没有太多的资料,请留意生物通的后续报道。