冷泉港免费发布高通量分析基因活性的方法

【字体: 时间:2008年03月05日 来源:生物通

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  冷泉港实验室免费发布两个分析基因活性的实验方法,题目分别是“甲基化CpG岛的放大和DNA甲基化 高通量分析的芯片”,“DNA免疫沉淀法:如何确定DNA结合的特异性”。这两项高通量的方法将会给我们的实验带来很大的帮助,革新我们对转录水平调节的理解。

  生物通报道:2008年3月的《Cold Spring Harbor Protocols》将发布两个分析基因表达和关闭的方法。这些新的高通量的方法将会革新我们对转录调节的理解。这两个方法都可在冷泉港实验室的网站免费获得。

通过对染色质的修饰而不是DNA序列的改变进行基因调节,这种被称为“表观遗传学”的知识近年来迅速增长。甲基化修饰是最常见的表观遗传调控机制之一。第一实验方法描述了如何快速地、在整个基因组范围内鉴定什么区域出现甲基化修饰。这个题为“Methylated CpG Island Amplification and Microarray (MCAM) for High-Throughput Analysis of DNA Methylation”的方法,是由安德森癌症中心的Marcos Estecio和Jean-Pierre Issa,以及俄亥俄州立大学癌症综合中心的earlly Yan和Tim Huang发明的。这个实验方法可直接访问http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2008/4/pdb.prot4974获取。研究人员已用这个方法,成功地对正常组织和肿瘤进行比较,以更好地理解导致癌症发生的因素。

第二个实验方法的网址是http://www.cshprotocols.org/cgi/content/full/2008/4/pdb.prot4972。这个方法是关于调节性的蛋白如何结合到DNA上。这些蛋白关闭或打开单个基因的活性方面起到作用。这个题为“DNA Immunoprecipitation (DIP) for the Determination of DNA-binding Specificity”的方法,使得研究人员能够找出调节性蛋白所结合的DNA序列。该技术能快速地在整个基因组检测这些结合位点,以深入了解这些蛋白质调控哪些基因。(生物通,揭鹰)
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