新蛋白质组学方法引领蛋白功能研究革命

　　

生物通报道：人类细胞是通过成千上万个蛋白质的协同作用来控制它们生长和分化的。但是，到目前为止，大多数人类蛋白质的特定功能还不清楚。

疾病的发生常常是由于冠军细胞蛋白质功能的失常。目前，世界各地已经启动了大量大规模的研究计划以了解所有人类蛋白质的功能。

现在，来自IRCM（Instiut de recherches cliniques de Montreal）的研究人员在7月20日的Molecular Cell杂志上发布的一篇文章描述了一种强大的蛋白质组学方法，该方法可能对我们目前了解人类蛋白质组和个体蛋白功能产生深远影响。

在这项研究中，研究人员利用蛋白质本身固有的特性开发出一种用于推断蛋白质功能的方法。Montreal研究组利用的这种独特的蛋白质特征就是蛋白质很少能单独起作用，而是与其他蛋白质装配成复合体来执行它们的功能。

IRCM的研究人员的策略主要是利用先进的蛋白质组学研究技术和他们自行开发的计算机运算方法，确定出许多已知功能蛋白质的相互作用伙伴。研究人员最初猜测相互作用的蛋白质可能是相同生物途径中的伙伴，并且可能具有相似或相关的功能。

 

通过系统地确定出32个已知在基因转录和DNA加工过程中起到特定作用的人类蛋白质的相互作用的同伴，该研究组已经构建出了连接436个不同蛋白质的805个高度确定的相互作用。

 

在这些蛋白当中，许多已经知道功能的蛋白质能够根据它们的相互关系来正确推出它们的功能。为了证实物理上相互作用的蛋白还在功能上具有相关性，研究人员选择了这个网络中一些之前未知功能的蛋白质来进行更详细的功能分析。

 

研究人员在文章中写道，他们用于确定功能相关作用伙伴的步骤的特异性惊人地高。例如，他们发现一种细胞酶调节小RNA分子在细胞功能和调节过程中所起的关键作用的稳定性。

 

虽然这种酶的重要性在十多年前就已经认识到了，但是到目前为止还不能将从细胞中分离出来进行进一步的研究。该研究组成功地找到了这种酶，并将其命名为MePCE，它是另外一种它调节的细胞蛋白的相互作用伙伴。在这项分析中，还发现了许多其他的重要蛋白质以及它们在细胞功能中的精确作用。这些新发现将在接下来的数月或数年发表。

 

确定调节细胞生长、分化和疾病相关蛋白质相互作用图谱是Human Proteotheque Initivative（HuPI）计划的总目标。HuPI计划的中心是它的实验平台 uPI，该平台最终将产生出蛋白质相互作用网络。而Molecular Cell杂志上的这篇文字则报道了第一代的这种技术平台。（生物通雪花）

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