方法学发现：精确解析DNA结合方式

　　

生物通报道：来自美国东北大学，霍利奥克山学院（Mount Holyoke College），明尼苏达州大学等处的研究人员发明了一种新的方法，能以无以伦比的精确性来研究小分子DNA绑定，由于通过插入（intercalation，一种与DNA相互作用的方式）这种方式结合的分子在许多生物化学过程中扮演了重要的角色，因此这一方法也许可以用于靶定癌症，AIDS及其它疾病的有效工具。这一研究成果公布在6月的《Nature Methods》杂志上。

原文摘要：
Nature Methods - 4, 517 - 522 (2007) 
Published online: 29 April 2007; | doi:10.1038/nmeth1044 
Quantifying force-dependent and zero-force DNA intercalation by single-molecule stretching
[Abstract]

东北大学Mark C. Williams表示，“科学家们为了能得到一种治疗癌症和其它疾病的新药物，需要更好的理解这些药物是否，以及如何与DNA结合的”，“这种方法将有利于我们精确高灵敏的检测插入方式”。

Williams及其同事利用单DNA分子分析溴乙锭（ethidium）和三钌复合物（three ruthenium complexes）DNA插入，通过检测不同配基浓度下配基诱导的DNA延长，研究人员能确定这种结合绑定的常量，以及作为一种功能力的位置大小。

利用这种方法，这只由多个研究院研究人员组成的小组将配体结合的插入方式与其它方式区分开来，并且确定了6个级别的插入结合的特征，包括不在实验允许的溶液条件下的配体。当配体的浓度增加的时候，DNA延伸弯曲能达到配体插入的最大级别。而且研究人员也首次描述了intercalator-saturated dsDNA的灵活性。

Williams和他的同事将进一步将这一方法用于癌症药物研究。
（生物通：张迪）