鉴定病毒细菌的新方法——Insignia

　　

生物通报道：现在，已经知道了数百种细菌和病毒的基因组序列，因此研究人员能够根据它们的DNA来设计出可迅速检测这些种类存在与否的方法。这些检测方法能够检测出一种复杂有机混合物中的某种病原物。

 

来自美国马里兰大学的Adam Phillippy和同事开发出了一种计算机程序，这种程序能够以比以往更高的精确度确定出这些细菌、病毒中与众不同的DNA标签。

 

研究人员将这种新的计算机系统称之为Insignia，并且已经成功用于鉴定46个霍乱弧菌。研究的结果刊登在本周的PLoS Computational Biology电子杂志上。

 

Insignia利用高效的运算法则，将已知的细菌和病毒基因组相互比较，并与背景基因组（包括植物、动物和人）进行比较。接着，将这些比较结果存在一个数据库，并用于快速确定任何特定靶标物种的计算机标签。

 

这个程序具有广泛的应用价值，如诊断人类感染以及检测水中的有害微生物。为了让不同学科的研究人员能够最充分地利用这个新成果，Insignia可以在作者的网页上获得：http://insignia.cbcb.umd.edu。（生物通雪花）

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