[新技术]自动蛋白取样技术

　　生物通报道：在看杂技的时候，逻辑性是非常重要的：当许多小丑成群结队的从一辆小型车中走出来的时候，你会猜想小车下面可能有一个隐藏着的开口，能够从下面通道走上来。但是在生命遗传的世界里，这种逻辑判断则未必适用。基因组中30,000个的基因是如何编码成400,000多个蛋白的呢？生命科学的研究人员正在试图回答这个问题，他们利用了许多种方法，其中就包括了双向凝胶电泳（two-dimensional gel electrophoresis，2DGE），通过一些自动取样器（automated spot pickers），研究人员能将这种长久以来一直是复杂复合蛋白研究的核心技术与高通量方法结合，更好的进行蛋白研究。

2DGE能基于蛋白的等电点（isolectric point）和分子量（molecular weight）这两个特征在凝胶上区分蛋白，通过染色，这些蛋白点能显现出来，并估算相对的数量。为了进一步分析单个的蛋白，就需要比如质谱之类的分析方法——将蛋白点从凝胶中分离出来，或者研究人员也可以利用差异凝胶电泳（difference gel electrophoresis，DIGE），这种技术主要依赖于不同颜色的染料，不同波长激光的扫描能获得可比较的两个凝胶，“因此蛋白水平的相对增加和降低都能被准确的定量。”[1]

传统而言，整个过程需要手工操作几天的时间，而自动取样器则可以将研究人员从这种繁重冗长的手工操作中解脱出来。研究人员需要做的就是将需要的参数输入进去，然后让机器连续不休息的运行，完成这项工作。一旦开始运行，自动取样器能记录下凝胶的数据图像，分析蛋白点，选取其中合适的一部分，这样不仅能节约时间，而且能避免一些人为操作的误差，提高精确度。

另外精确性还来源于遵循精确的规则和运算法则的软件。一个好的数字也许需要DIGE数据，但一维的和二维的凝胶也有帮助，分析可以有助于确定哪些蛋白点应该被选取出来，如果还需要其它，那么可以考虑购买能分析数据图和鼠标选择的仪器，这样先进的图像技术，融合高分辨率的程序能获得更多详细的数据，从而提高灵敏度。
（生物通：张迪）

参考文献：

1 MW Duncan and SW Hunsucker, “Proteomics as a Tool for Clinically Relevant Biomarker Discovery and Validation”, Experimental Biology and Medicine, 230(11):808-817, December 2005.